( PDF ) Filogeografia dos cromossomos Y e das linhagens mitocondriais de origem africana em populações negras brasileiras

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Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Biociências

Departamento de Genética

FILOGEOGRAFIA DOS CROMOSSOMOS Y E DAS LINHAGENS

MITOCONDRIAIS DE ORIGEM AFRICANA EM POPULAÇÕES

NEGRAS BRASILEIRAS

Tábita Hünemeier

Dissertação submetida ao Programa de Pós-

Graduação em Genética e Biologia Molecular da

UFRGS como requisito parcial para a obtenção do

grau de Mestre.

Orientadora: Prof ª Dr ª Maria Cátira Bortolini

Porto Alegre, março de 2006.

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Este trabalho foi desenvolvido no Laboratório de

DNA e no Laboratório de Eletroforese do

Departamento de Genética da Universidade

Federal do Rio Grande do Sul e no Laboratório

de Bioquímica e Imunologia do Instituto de

Bioquímica da Universidade Federal de Minas

Gerais, com auxílio financeiro do Conselho

Nacional de Pesquisa (CNPq).

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A verdadeira universidade não se localiza num

lugar específico. Não tem propriedades, não

paga salários, não recebe taxas materiais. A

verdadeira universidade é um estado de

espírito. É a grande herança do pensamento

racional que nos foi legada ao correr dos

séculos e que não tem lugar específico para

ficar. É um estado de espírito que se renova

através dos séculos, graças a um grupo de

pessoas que ostentam tradicionalmente o título

de professor, título esse que, no fundo, também

não faz parte da universidade. A verdadeira

universidade é nada mais nada menos que o

corpo contínuo da razão em si.

Robert M. Pirsig

em Zen e a Arte da Manutenção de

Motocicletas.

SUMÁRIO

RESUMO............................................................................................................

ABSTRACT........................................................................................................

I. INTRODUÇÃO...............................................................................................

I.1. Considerações Gerais.......................................................................

I.2. O Homo sapiens e sua Diversidade..................................................

I.3. Os Africanos......................................................................................

I.3.1. Os Troncos Lingüísticos Africanos......................................

I.3.2. Oeste-africanos....................................................................

I.3.3. Bantus..................................................................................

I.4. Diáspora Africana: O Escravismo Colonial................. .....................

I.4.1. Os Africanos no Novo Mundo..............................................

I.4.2. As Origens dos Africanos....................................................

I.4.3. Os Africanos no Rio de Janeiro...........................................

I.4.4. Os Africanos no Rio Grande do Sul.....................................

I.5. Dados Genéticos e a Origem dos Africanos do Brasil......................

I.5.1. DNA Mitocondrial..................................................................

I.5.2. Cromossomo Y....................................................................

II. OBJETIVOS...................................................................................................

III. ARTIGO.........................................................................................................

iii

IV. DISCUSSÃO.................................................................................................

V. REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS..............................................................

VI. APÊNDICES................................... .............................................................

VI.1. Material e Métodos..........................................................................

VI.1.1. Populações de Estudo.......................................................

VI.1.2. Extração de DNA...............................................................

VI.1.3. DNA Mitocondrial...............................................................

VI.1.4. Marcadores do Cromossomo Y.........................................

VI.1.5. Análise de Dados..............................................................

VII.ANEXOS ......................................................................................................

VII.1. Resultados Adicionais....................................................................

RESUMO

Há algum tempo dados genéticos vêm sendo utilizados para inferências

quanto à natureza do tráfico de escravos ocorrido no período colonial no Atlântico

Sul e sobre a origem dos africanos que chegaram ao Brasil. A utilização de

marcadores de linhagem mais específicos, como é o caso do DNA mitocondrial

(mtDNA) e da região não-recombinante do cromossomo Y (NRY) pode se

constituir em poderoso instrumento para o esclarecimento dessas questões.

Este trabalho utilizou esses enfoques através do seqüenciamento da HVS-I

do mtDNA (highly variable segment I) e de testes em 30 SNPs (single nucleotide

polymorphisms) localizados na região não-recombinante do cromossomo Y, em

uma amostra de 133 indivíduos classificados como derivados de africanos (preto

e pardo) do estado do Rio Grande do Sul (Porto Alegre e região metropolitana),

bem como 144 homens classificados do mesmo modo no estado do Rio de

Janeiro (Rio de Janeiro e região metropolitana).

Os dados do mtDNA indicaram que 89,5% e 78% das matrilinhagens

encontradas, respectivamente, no Rio de Janeiro e em Porto Alegre eram de

origem africana. Destas, 69% e 82% eram de origem da África Centro-oeste

(região típica de povos que falam línguas Bantus), enquanto que a fração

complementar teria uma origem no Oeste africano (não-Bantu). Estes resultados

estão de acordo com os registros históricos.

Os marcadores do cromossomo Y revelaram que 56% (Rio de Janeiro) e

36% (Porto Alegre) destes cromossomos tinham uma origem africana. No

entanto, diferentemente do que aconteceu com o mtDNA, as análises não

permitiram discriminar os locais de origem dentro do continente africano. Parece,

portanto, haver maior estruturação nos dados obtidos com o mtDNA do que com o

cromossomo Y, sugerindo uma maior taxa de migração dos homens do que das

mulheres dentro do grande tronco lingüístico Niger-Congo.

Porto Alegre e Rio de Janeiro quando comparadas em relação ao mtDNA,

não apresentam diferenciação significativa, embora pudessem ser observadas

algumas diferenças, em destaque a maior presença de linhagens mitocondriais de

origem ameríndia em Porto Alegre (16,4%) do que no Rio de Janeiro (8,5%).

Já a diferença entre Porto Alegre e o Rio de Janeiro foi significativa quanto

aos dados do cromossomo Y. Especialmente notável, é a presença de

cromossomos de origem indígena em Porto Alegre: haplogrupos Q* e Q3*, nas

freqüências de 3,5% e 1,7%, respectivamente.

Analisando somente os indivíduos tipados tanto para o mtDNA quanto para

os marcadores do Y, nota-se que ∼ 50% deles nas duas amostras apresentam

linhagens mitocondriais e do cromossomo Y de origem africana, enquanto de

forma complementar, o número de indivíduos com matrilinhagens africanas e

cromossomos Y europeus e/ou asiáticos ou ameríndios foi de ∼ 41% e ∼ 35%

para o Rio de Janeiro e Porto Alegre, respectivamente. As amostras estudadas,

portanto, caracterizam-se como sendo amplamente mescladas, apenas metade

dos genomas considerados sendo de origem completamente africana.

iii

ABSTRACT

Genetic data have been used for some time now for inferences about the

nature of the slave trade that occurred in South Atlantic in the Colonial Period, as

well as about the origins of the Africans who arrived in Brazil. The use of lineage-

specific markers, like mitochondrial DNA (mtDNA) and those of the non-

recombining region of the Y chromosome (NRY), can constitute a powerful tool for

elucidation of these questions.

This work utilized this approach through sequencing of the mtDNA HVS-I

(highly variable segment I), as well by testing 30 SNPs (single nucleotide

polymorphisms) located in chromosome Y’s nonrecombining region in a sample of

133 individuals classified as African-derived (black or mulatto) from the state of

Rio Grande do Sul (Porto Alegre and metropolitan region), as well as 144 men

classified in the same manner in the state of Rio de Janeiro (Rio de Janeiro and

metropolitan region).

The mtDNA data indicated that 89.5% and 78% of the matrilineages found

in Rio de Janeiro and Porto Alegre were of African origin. Of these, respectively,

69% and 82% were of Central-West African origin (region typically of people who

speak Bantu languages), while the complementary fraction would have the West

African origin (non-Bantu). These results are in accordance with the historical

records.

The Y chromosome markers revealed that 56% (Rio de Janeiro) and 36% (Porto

Alegre) of these chromosomes should have an African origin. But differently of

what occurred with the mtDNA results, the analyses did not allow a discrimination

of the places of their origin within the African continent. It seems, therefore, that a

higher structuration occurs in the mtDNA data as compared to the Y chromosome

results, suggesting a higher male in relation to female migration rates within the

large Niger-Congo linguistic family.

Porto Alegre and Rio de Janeiro do not present significant mtDNA

frequency differences, although the Amerindian mtDNA presence is higher in

Porto Alegre (16.4%) than Rio de Janeiro (8.5%).

On the other hand, Porto Alegre and Rio de Janeiro do show significant

differences in the Y chromosome data. Especially notable is the presence of

Amerindian chromosomes in Porto Alegre: frequencies of, respectively, 3.5% and

1.7% for haplogroups Q* and Q3*.

Considering just the individuals simultaneously typed for mtDNA and the Y

chromosome, it is verified that ~50% of then show mtDNA and Y chromosome

lineages of African origin, while the number of individuals with African mtDNA but

European and/or Asiatic or Amerindian lineages was ~41% for Rio de Janeiro and

~35% for Porto Alegre. The samples studied, therefore, can be characterized as

amply admixed, only half of the genomes considered being completely of African

origin.

I. INTRODUÇÃO

I.1. Considerações Gerais

Marcadores de linhagens de herança uniparental, tais como o DNA

mitocondrial e o cromossomo Y, vêm constituindo-se em poderosos instrumentos

para estudos filogeográficos das populações humanas. Por exemplo, tem sido

demonstrado que o nível de mistura entre europeus, africanos e ameríndios foi

extenso, e que o peso dos cruzamentos assimétricos na era colonial (homem

europeu com mulheres indígenas e africanas) foi determinante na formação da

população brasileira (Bortolini e cols., 1999; Alves-Silva e cols., 2000; Carvalho-

Silva e cols., 2001; Salzano e Bortolini, 2002). Desta forma, não se pode

pretender que apenas os indivíduos com sinais fenotípicos de mistura

representem o grupo híbrido (Bortolini, 1999; Parra e cols. 2003). Tem sido

constatado ainda que cruzamentos assimétricos são também uma marca do

colonialismo espanhol (Carvajal-Carmona e cols., 2000), embora com diferenças

notáveis entre paises (Bortolini e cols., 2004a).

No Brasil, de acordo com Telles (2003), existem três grandes sistemas

associados à chamada “classificação racial”: (1) os censos do IBGE que

distinguem três categorias (brancos, pardos e pretos); (2) o discurso popular que

utiliza uma nomenclatura ampla, inclusive o termo bastante ambíguo “moreno” e

(3) o sistema do movimento negro que distingue apenas duas categorias,

reunindo pardos e pretos como “negros”. O governo brasileiro parece ter optado

por esta última (Telles, 2003). Mais recentemente, a expressão afrodescendente

tem sido incorporada a essa etnosemântica (Pena e Bortolini, 2004).

Considerando outros países da América Latina, outras terminologias aparecem

em contextos que podem diferir significativamente daquele encontrado na

sociedade brasileira (Salzano e Bortolini, 2002). Sabe-se, contudo, que existe

arbitrariedade em qualquer uma das opções escolhidas. Neste trabalho, para

facilitar, a palavra “negro” será usada para o conjunto amplo, envolvendo pessoas

identificadas e/ou auto-identificadas como pretos, pardos ou qualquer outra

designação que reporte ancestralidade africana através de características

fenotípicas.

I.2. O Homo sapiens e sua diversidade

A história evolutiva do gênero Homo inicia na África há cerca de 2,5

milhões de anos com o aparecimento do Homo habilis. Este origina-se de uma

espécie de Australopithecus, gênero composto de várias espécies bem distintas

morfologicamente, sendo que somente o antecessor do homem moderno, o A.

afarensis deixou descendentes.

Há aproximadamente 1,7 milhões de anos surge o Homo erectus, derivado

do Homo habilis, e este deixa a África para colonizar a Ásia e a Europa. O Homo

erectus é então o provável ancestral do Homo sapiens, que surge na África há

cerca de 200 mil anos (Lewin, 1999).

Inúmeras análises filogenéticas da espécie humana com base em

diferentes grupos de dados, como mtDNA, polimorfismos nucleares, marcadores

do cromossomo Y, têm sido feitas nas últimas décadas. Esse conjunto de

informações aponta para uma grande diferença entre populações africanas

quando comparadas com outras populações humanas, o que corrobora a

hipótese de surgimento do homem moderno no continente africano, tendo o

mesmo começado sua expansão para outras partes do mundo há cerca de 100

mil anos. Então, desde seu surgimento até o inicio da expansão, o homem

moderno teve um longo período de tempo para o aumento de sua variabilidade e

dispersão dentro da própria África (Cavalli- Sforza, 1994).

Apesar do foco do debate da evolução humana ser a origem, a questão da

diversidade humana tem sempre sido uma parte importante desse debate. A

diversidade das populações humanas tem sido fonte de discussões tanto

científicas quanto sociais (debate sobre a questão da existência ou não de “raças”

biológicas dentro da nossa espécie, por exemplo) há tempos, e teorias para

explicar a diversidade dentre os grupos geográficos humanos têm sido cada vez

mais numerosas (Lahr e Foley, 1996).

Desde o surgimento das teorias evolutivas há 150 anos, houve uma

mudança na percepção das diferenças humanas. No início, a ênfase era a da

diversidade como expressão da existência de “raças puras”. O apogeu desta

crença foi na primeira metade do século XX, onde o mundo presenciou guerras de

cunho racista, justificadas num falso contexto biológico. Devido a isso, e

considerando que tanto a pesquisa biológica quanto à antropológica são fontes

que dão suporte científico para esse tipo de ideologia confusa, se torna

indispensável que o conhecimento sobre a diversidade humana seja estudado de

forma intensa e com rigidez científica.

Dentro da pesquisa biológica, a Genética tem dado contribuições

fundamentais ao entendimento da diversidade entre os povos, e fatores e

processos que levaram a essa diferenciação.

I.3. Os Africanos

Na genética de populações é imprescindível o estabelecimento dos

melhores preditores das relações genéticas entre as populações humanas. Muitos

estudos indicam a existência de forte correlação entre genética e lingüística ou

geografia entre populações distribuídas nos diferentes continentes (Cavalli -

Sforza et cols, 1988; Chen et al, 1995). Estudos com marcadores de linhagens

(cromossomo Y e DNA mitocondrial - mtDNA) revelam um panorama interessante

neste contexto. Por exemplo, em sul-ameríndios, estudos com mtDNA revelaram

uma forte correlação entre língua e aspectos genéticos (Fagundes et al., 2002;

Torres et al., 2006), mas quando são considerados os marcadores do

cromossomo Y, nota-se uma correlação entre geografia e o background genético

(Zegura et al, 2004).

No continente africano, as relações entre genes e línguas têm sido

controversas, sendo que estudos mais recentes com marcadores do cromossomo

Y e mtDNA apontam a geografia como bom preditor (Scozzari et al., 1999; Salas

et al, 2002) , enquanto outros indicam a linguagem (Excoffier et al., 1987). Wood

et al. (2005) em seu trabalho, encontraram pela primeira vez uma correlação entre

dados dos marcadores do cromossomo Y e a diferenciação lingüística da África,

particularmente devido a recente e extraordinária expansão de povos que falam

línguas identificadas com o grande tronco Bantu (ver abaixo).

A Revolução do Neolítico influenciou de forma marcante a distribuição

lingüística da África. Tanto dados lingüísticos, quanto arqueológicos e

etnográficos sugerem que os troncos lingüísticos da África surgiram antes do

desenvolvimento da agricultura, e as dispersões de alguns deles estão fortemente

associadas ao domínio das técnicas agrícolas (Diamond et al, 2003).

Provavelmente, os primeiros fazendeiros ocuparam as terras dos caçadores-

coletores, o que levou a forte correlação entre língua e genética encontrada por

alguns autores (Cavalli-Sforza, 1994; Diamond, 2003; Wood et al; 2005).

Exemplo disso é associação entre a expansão do grupo lingüístico Bantu e a

dispersão da agricultura no continente africano, como poderá ser visto em

maiores detalhes nos itens a seguir.

I.3.1. Os Troncos Lingüísticos Africanos

Na África atual são faladas cerca de mil e quatrocentas línguas de acordo com

a classificação de Greenberg (1963), a qual tem sido de modo geral amplamente

aceita (Campbell, 1997). Esse número corresponde a um terço do total de línguas

faladas na atualidade.

As línguas africanas se dividem em quatro principais troncos lingüísticos:

1. Coissã: esse tronco é formado por 30 línguas caracterizadas por estalos ou

cliques. É falado por, aproximadamente, 120.000 pessoas que habitam o

sudoeste da África, com exceção de duas línguas que são faladas por tribos

da Tanzânia. Estes povos, também conhecidos como Khoi-San, eram

caçadores-coletores até a chegada de outros povos que dominavam as

técnicas agrícolas. Alguns grupos ainda permanecem caçadores coletores

habitando as imediações do deserto do Kalahari.

2. Nilo-saariano: é um grupo relativamente pequeno, compreendendo 140

línguas faladas por onze milhões de africanos. É falado por diversos povos,

desde pastores nômades até os que dominam a agricultura, todos habitantes

das regiões próximas ao Rio Nilo, no deserto Saara.

3. Afro-asiático: essa família é constituída por 240 línguas faladas no norte do

Saara, por povos mediterrâneos e também árabes.

4. Niger-cordofanianano: é o maior tronco lingüístico da África, com cerca de

1.000 línguas faladas por cerca de 180 milhões de pessoas. O ramo Niger-

Congo é o maior subphylum e de uma forma muito simplificada, pode ser

dividido em dois grandes grupos. São eles, Oeste-africanos e Bantus, esses

habitam a maior parte da região sul-saariana do continente (figura 1).

Figura 1: Distribuição atual dos troncos lingüísticos no continente africano.

(Fonte: http://www.linguasphere.org/map.html)

I.3.2. Oeste-africanos

Os Oeste-africanos possuem uma relativa unidade biológica e cultural.

Ocupam a porção centro-atlântica do continente africano entre o Equador Tropical

e o Trópico de Câncer (Figura 2).

Esses povos tiveram uma expansão lenta e que teve seu começo em há

cerca de 50 mil anos (Cavalli-Sforza, 1994). Embora o deserto do Saara seja uma

barreira geográfica importante, esses povos apresentam características culturais

e genéticas que indicam um relativo e continuo contato com populações norte-

saarianas, evidenciada por exemplo pela presença do Islamismo em nações da

costa norte da Guiné, e, também, pelos altos índices de heterogeneidade

encontrados nesses povos do oeste quando comparados com Bantus (Cavalli-

Sfroza, 1994).

Figura 2: Distribuição dos povos oeste-africanos (Niger-Congo A) e Bantus (Niger-

Congo B) no continente africanos.

(Fonte: http://en.wikipedia.org/wiki/Bantu_expansion)

I.3.3. Bantus

Os Bantus possuem cerca de 500 línguas faladas por mais de 100 milhões

de pessoas que habitam o centro-sul do continente africano. Esses povos tiveram

uma expansão territorial intensa e recente, há cerca de 3 mil anos eles saíram da

região que hoje compreende a fronteira da Nigéria com Camarões e ocuparam

todo o centro-sul da áfrica.

Tal expansão se deu em duas etapas, uma primeira na qual a migração

aconteceu até as proximidades do Trópico de Capricórnio e uma segunda, até o

extremo sul da áfrica. A figura 3 mostra as etapas da expansão.

Os Bantus à medida que se expandiam para o sul passavam a ocupar as

terras de povos caçadores-coletores, como os Coissãs e Pigmeus. Essa

espetacular expansão territorial está diretamente relacionada à Revolução do

Neolítico, pois foi o domínio da metalurgia e das técnicas agrícolas que

possibilitaram a formação de uma estrutura social organizada, com presença de

exército, armas e equipamentos agrícolas. Tendo esses fatores contribuído para a

dispersão rápida e o domínio de outros povos pelos Bantus. Como visto acima,

junto com a maior parte dos Oeste-africanos (exceção são os Haussá da Nigéria)

os Bantus fazem parte do importante subphylum linguístico Niger-Congo.

Figura 3: Etapas da expansão Bantu dentro da África.

(Fonte:http://www.yorku.ca/kdenning/+3510%202005-6/3510sept26-2005.htm)

I.4. Diáspora africana: o Escravismo Colonial

No século XV parte da história dos povos sul-saarianos passa a ser escrita

fora do continente africano, marcada particularmente por uma nova forma de

escravismo nunca vista antes na história da humanidade, o escravismo colonial.

Este sistema se apresenta estruturalmente mercantil, constituindo-se de um

sistema de produção, tendo a escravidão sido convertida em escravismo, ou seja

uma escravidão em larga escala por um longo período de tempo. Deste modo,

pode-se dizer que este sistema de produção foi uma conseqüência do Sistema

Colonial Mercantilista, onde as colônias possuíam objetivo único de desenvolver e

prover a metrópole. Neste contexto os escravos não eram somente para

abastecer a mão-de-obra de um império, ou como prova do poder de um povo

sobre outro, mas sim, produtores de mercadorias a serem vendidas, sendo vistos

a partir desse momento como base de uma alternativa econômica.

Dentro desse sistema mercantil, Portugal estabeleceu o maior e mais

lucrativo empreendimento escravista da época, trazendo africanos capturados

para trabalhar como escravos no Brasil e nas demais colônias portuguesas. E,

diferentemente dos outros países da Europa, Portugal promoveu uma efetiva

colonização em suas colônias na África, particularmente em Angola a partir do

século XVI, possibilitando assim, a manutenção de um fluxo constante de

escravos para o Brasil (Klein, 2002).

A captura e tráfico desses africanos para o Novo Mundo, leva a uma óbvia

desestruturação das sociedades sul-saarianas e a emergência de uma nova

formação social na América, com a presença do componente africano (Maestri-

Filho, 1988).

I.4.1. Os africanos no Novo Mundo

Os primeiros africanos chegaram ao Novo Mundo no início do século XVI,

mais precisamente em 1502, em São Domingos, na América Central (Salzano e

Freire-Maia, 1970). Durante estes quatro séculos, nove e meio milhões de

africanos, oriundos da região ao sul do deserto do Saara, foram transportados

como escravos para as colônias européias na América. Destes, 40% teriam

chegado ao Brasil (Klein, 2002). Hoje, o número de descendentes desses

africanos que vivem na América é comparável ao número de indivíduos negros do

continente africano. Se considerarmos ainda, o número de indivíduos com algum

grau de ancestralidade genética africana, independente da característica

fenotípica, chegaremos a números bem impressionantes; cerca de 90 milhões de

brasileiros apresentam mtDNA de origem africana e cerca de 140 milhões de

brasileiros apresentam mais de 10% de ancestralidade africana considerando

marcadores nucleares (Pena e Bortolini, 2004).

I.4.2. As origens dos africanos

Sabe-se que, embora a migração para o Brasil tenha envolvido africanos

de várias partes do continente, as regiões que hoje compreendem Angola, a

República Democrática do Congo, e a República do Congo tiveram papel

majoritário (Goulart, 1975; Klein, 2002). Essa região é típica de povos

genericamente definidos como Bantus. Porém, a vinda de oeste-africanos

também foi significativa, particularmente em algumas regiões como a Bahia

(Klein, 2002). Assim, com raríssimas exceções teriam chegado ao Brasil povos

que falavam linguas identificadas com o grande subphylum Niger-Congo.

I.4.3. Os africanos no Rio de Janeiro

O porto do Rio de Janeiro foi o maior importador de escravos do Brasil do

final do século XVIII a quase metade do século XIX, recebendo

predominantemente escravos enviados da África Centro–Ocidental ou Central-

Atlântico, provavelmente devido a sua posição geográfica (Tabela 1). Entretanto,

se considerarmos um intervalo de tempo maior do que aquele apresentado na

tabela 1, os números podem ser um pouco diferentes: cerca de 70% teriam

origem na África Centro-Ocidental/Sudeste, enquanto 30% teriam chegado da

África Ocidental (Klein, 2002).

Na composição da população negra do Rio de Janeiro nos anos de 1822-

1833, 86% dos escravos eram recém chegados do continente africano e 14%

nascidos ou já residentes na América portuguesa (Florentino, 1997). Destes, a

maioria era do sexo masculino, com uma taxa de masculinidade de 3:1, sendo a

faixa etária predominante de 15-49 anos.

Tabela 1: Origem dos escravos que aportaram no Rio de Janeiro entre 1795 –

1811.

Origem dos africanos %

África Ocidental

São Tomé

Costa da Mina

Calabar

África Central-Atlântico

Malembo

Cabinda

Rio Zaire

Luanda

Benguela

África Oriental (Sudeste)

Moçambique

Nota: adaptado de Klein (2002)

I.4.4. Os africanos no Rio Grande do Sul

A mão-de-obra escrava chegou tardiamente ao Rio Grande de São Pedro.

Somente no final do século XVIII, com o crescimento da indústria do charque, dá-

se início a introdução sistemática de escravos nesta província. Em 1814, o Rio

Grande contava com aproximadamente 30% de negros na população (Maestri-

Filho, 1984).

O Continente de São Pedro, designação do Rio Grande do Sul colonial,

participava apenas do comércio doméstico de escravos, ou seja, abastecia-se

apenas a partir dos outros portos da Colônia, sem estabelecer negociações

diretas com o continente africano.

O Rio de Janeiro além de ser o maior porto importador de africanos entre

os anos de 1790 e 1830 nas Américas, conceituava-se também como o maior

distribuidor da Colônia, destinando a maior parte dessas levas de escravos para o

interior e outras províncias, incluindo o Rio Grande do Sul (Tabela 2).

Segundo a documentação das Guias de Escravos do Arquivo Histórico do

Rio Grande do Sul, entre os anos de 1788 e 1802, chegaram ao Rio Grande do

Sul Colonial três mil e trezentos escravos, dos quais 65% teriam acabado de

chegar do continente africano e 35% eram nascidos ou já viviam no Brasil

(identificados como ladinos; Berute, 2004). Desta forma, comparando com os

dados do Rio de Janeiro constata-se uma presença muito maior de escravos

ladinos (escravos que já viviam há algum tempo ou haviam nascido no Brasil).

No que se refere ao sexo dos escravos chegados ao Rio Grande do Sul,

69% eram do sexo masculino e 31% do sexo feminino. Indicando uma razão de

masculinidade de 2:1 (Berute, 2004). Uma razão de masculinidade 40% menor do

que a encontrada no Rio de Janeiro por Florentino (1997). Já quando a

comparação é feita com a população escrava da Bahia, a taxa de masculinidade

mantém-se semelhante.

Dentre os escravos trazidos para o Rio Grande de São Pedro, predominava

a presença de escravos jovens (0-14 anos), o que não era ocorria nas do

capitanias Rio de Janeiro e Bahia, onde a maioria dos escravos era adulta (15-49

anos; Berute, 2004).

Tabela 2: Porto de Origem dos escravos trazidos para o Rio Grande de São

Pedro de 1788 a 1802.

Porto de Origem dos Escravos %

Rio de Janeiro 88

Bahia 6

Santa Catarina 3

Pernambuco 2

Berute (2004) também apresenta os dados referentes à origem dos

escravos que aqui chegaram. Visto serem majoritariamente vindos do Rio de

janeiro, é de se esperar uma certa replicação da origem vista para o Rio de

janeiro (Tabela 3). Porém, da mesma forma como visto para o Rio de Janeiro, se

considerarmos um intervalo de tempo maior, as proporções são um pouco

diferentes como atesta Maestre-Filho (1993): cerca de 80% teriam origem na

África Centro-Ocidental/Sudeste, enquanto 20% teriam chegado da África

Ocidental. Mais uma vez, os valores são próximos daqueles observados para o

Rio de Janeiro em igual período. A diferença fica por conta do fato de ter chegado

ao Rio grande do Sul um número 10% maior de escravos Bantus (Centro-

Atlântico/Sudeste).

Tabela 3: Origem dos Escravos trazidos para o Rio Grande de São Pedro, 1788 –

1802. (Berute, 2004).

Origem dos africanos %

Central-Atlântico

Angola 31

Benguela 41

Cabinda 1

Cassange 2

Congo 3

Monjolo 1

Quissana 1

Rebolo 5

África Ocidental

Costa da Mina 3

Outros/ladinos

Nota: Modificado de Klein (2002)

I.5. Dados Genéticos e a Origem dos africanos que aportaram no Brasil

Dados gerados a partir de estudos genéticos vêm sendo utilizados para

inferências quanto à natureza do tráfico no Atlântico sul, e sobre a origem dos

africanos que aqui chegaram, há mais de uma década (Bortolini, 1991; Bortolini e

cols., 1994). Porém, com o advento das técnicas da Biologia Molecular, foi

possível considerar a possibilidade de uma contribuição mais precisa da Genética

para o resgate de eventos históricos, incluindo aqueles relacionados ao tráfico de

escravos. Inicialmente, investigações com haplótipos do gene da Beta globina

foram utilizados para definir a origem mais precisa dos africanos que chegaram

ao Brasil (Zago e cols., 1992; Figueiredo e cols., 1994) e em outros países

americanos (revisão em Salzano e Bortolini, 2002). Esses estudos estavam

fundamentados no fato de que existem diferentes haplótipos associados ao alelo

*S. A provável razão para esta diversidade seria a ocorrência da mutação

*A → Hb

*S mais de uma vez em diferentes regiões da África (Pagnier e

cols., 1984). Existiriam, assim, quatro diferentes haplótipos associados ao alelo

*S: Bantu, Benin, Senegal e Camarões, sendo que os nomes reportam às

regiões de origem das mutações. O haplótipo Bantu era conhecido inicialmente

como CAR, sigla do inglês que se refere à República Centro Africana, já que o

haplótipo foi descrito pela primeira vez em populações deste país da África

Central. Porém, trabalhos posteriores mostraram que é o haplótipo mais comum

em toda a África Bantu (Salzano e Bortolini, 2002). Um quinto evento mutacional

teria ocorrido fora da África sul-saariana, já que um outro haplótipo, denominado

Árabe-asiático, é encontrado no Oriente Médio e Índia. Na extensa revisão sobre

o tema, apresentada por Salzano e Bortolini (2002), é possível ver que 61%, 34%

e 3% dos haplótipos encontrados no Brasil como são do tipo Bantu, Benin e

Senegal, respectivamente, sendo a Bahia o estado onde o haplótipo Benin é mais

freqüente (45%). Esse conjunto de dados corrobora as sugestões históricas de

que a maioria dos escravos que aqui chegaram pertenciam a povos, como visto

anteriormente, genericamente definidos como Bantus.

Mais recentemente uma outra possibilidade utilizando técnicas moleculares

vem mostrando-se bastante promissora para estudos desta natureza: é a

utilização de marcadores de linhagem, mais específicos, como é o caso do DNA

mitocondrial (mtDNA) e de marcadores localizados na região não-recombinante

do cromossomo Y (NRY).

I.5.1. DNA Mitocondrial

O genoma mitocondrial humano é constituído de DNA circular, fita dupla,

sendo um genoma pequeno se comparado ao nuclear (~16 kb), e altamente

mutável. Segundo Strachan and Read (2002) a região mais variável do genoma

mitocondrial é a alça de deslocamento (alça D ou D-loop), uma pequena região

desprovida de qualquer seqüência codificadora. A maior parte dos sítios

polimórficos desta alça estão concentrados em dois segmentos hipervariáveis,

HVS-I e HVS-II, sendo que a grande maioria das informações de seqüências de

mtDNA publicadas até o momento é relativa à HVS-I.

A herança mitocondrial é matrilinear (homens e mulheres herdam de suas

mães, mas apenas as mulheres a transmitem às gerações seguintes), fato que,

juntamente com suas características de ser não-recombinante e haplóide, permite

a construção de filogenias moleculares precisas. Além disso, as mutações que

ocorreram no DNA mitocondrial após a dispersão geográfica do homem moderno

geraram variações que podem servir como marcadores geográficos por serem

específicas de certos continentes (Pena e Bortolini, 2004).

Estudos demonstraram que 80% e 28% dos genomas mitocondriais dos

brasileiros, identificados como negros e brancos, respectivamente, eram de

origem africana (Bortolini e cols., 1997; Alves-Silva e cols. 2000). Estes dados

salientam que a proporção de linhagens típicas da África é marcante, seja em

pessoas identificadas como brancas seja naqueles identificadas como negras,

tornando possível estimar que ~89 milhões de pessoas no Brasil carregam

genomas mitocondriais com origem na África ao sul do Saara (Pena e Bortolini,

2004). Isso salienta que as populações brasileiras representam um extraordinário

reservatório de linhagens mitocondriais africanas.

Salas e cols. (2002, 2004a) determinaram a distribuição geográfica dos

diversos haplogrupos mitocondriais na África sul-saariana: a região que apresenta

a maior proporção dos haplogrupos denominados L3e e L1c é a África Centro-

ocidental, já os haplogrupos L3d e L1b são característicos da África Ocidental

(compreendendo toda a costa norte do Golfo da Guiné). Salas e cols. (2004a)

também estimaram a proporção das linhagens mitocondriais sul-saarianas de

origem Centro-ocidental nas Américas do Norte, Central e Sul, como sendo de

41% , 28% e 65%, respectivamente (valores complementares teriam origem na

África Ocidental). Em um trabalho anterior o mesmo grupo de pesquisadores

sugeriu que a região leste africana, Tanzânia e Quênia, poderia ter tido um papel

mais importante do que aquele referido na historiográfica como fonte de origem

dos africanos que aqui chegaram (Salas e cols., 2002, 2004a). Esse fato seria

devido à presença na ordem de 3,5% do haplogrupo L3g em populações

brasileiras (Bortolini e cols., 1997 e Alves-Silva e cols., 2000), pois este tipo de

genoma mitocondrial não havia sido descrito em nenhum grupo Bantu, nem

tampouco na África Ocidental. Ao avaliar essa possibilidade, Bortolini e cols.

(2004b) constataram que L3g também está presente em vários grupos étnicos de

Camarões e possivelmente em outras populações da bacia do Congo na África

Centro-ocidental. No mesmo trabalho, os autores definiram que a presença de

L3g em Camarões e adjacências era devido a uma importante migração interna

no continente africano no sentido leste→oeste (Bortolini e cols., 2004b). Num

trabalho mais recente, Salas e cols. (2004b) apresentam evidências adicionais

corroborando a proposta de Bortolini e cols. (2004b).

Salas e cols (2005), analisaram as seqüências de afro-americanos

disponíveis nos bancos de dados, tendo encontrado altas freqüências dos

haplogrupos oeste africanos (L1b, L2b, L2c, L2d, L3b e L3d) e centro-oeste

africanos (L1c e L3e), o que sugere que indivíduos dessas regiões devem ter sido

trazidos em grande número para a América. Linhagens do leste africano (L3*, L1f

e L1g), foram encontradas em baixa freqüência, fato que vai ao encontro dos

registros históricos. Seqüências do norte da África se encontram numa freqüência

menor o que 1%, e os haplogrupos de origem Coissã (L0d e L0K), não foram

encontrados nesse estudo, o que indicaria, num primeiro momento, que nenhum

escravo trazido para a América pertence a este grupo.

I.5.2. Cromossomo Y

A região não-recombinante do cromossomo Y (NRY) apresenta

polimorfismos que mutam com relativa freqüência (microssatélites ou STRs), bem

como polimorfismos que surgiram por mutações mais raras, que teriam ocorrido,

por exemplo, uma única vez na história evolutiva do Homo sapiens. Estes últimos

são denominados de polimorfismos de base única, normalmente bialélicos (SNPs

- Single Nucleotide Polymorphisms ou UEPs - Unique Event Polimorphisms;

Thomas e cols., 2000). Inúmeros SNPs vêm sendo identificados na região não-

recombinante do cromossomo Y (Underhill e cols., 2000), sendo que alguns deles

são geográfico-específicos, tais como Q3*, Q*, Q3a, (Ameríndio), P* (Europeu) e

E3* (Africano). Por essa razão, marcadores bialélicos na NRY são considerados

excelentes marcadores de linhagem. Alguns estudos ainda têm utilizado

concomitantemente marcadores bialélicos e locos de STRs para caracterizar os

cromossomos Y. Com base neste tipo de dados, sejam SNPs, STRs ou ambos,

pode-se, então, com relativa precisão indicar a origem de um determinado

cromossomo Y. Conseqüentemente, foram geradas novas informações que

puderam ser utilizadas para o resgate da história evolutiva das populações

humanas, sejam elas nativas (Underhill e cols., 2000; Bortolini e cols., 2002,

2003), ou miscigenadas (Castro-de-Guerra e cols., 2003; Bortolini e cols., 2004a).

Recentemente, estudos subdividiram através de marcadores bialélicos

localizados no cromossomo Y o haplogrupo E* (caracterizado pela presença de

uma inserção Alu-YAP) em E1*, E2* e E3*, sendo que esses ainda podem ser

subdivididos em vários sub-haplogrupos cada (Cruciani e cols., 2004). As

diferentes distribuições geográficas desses haplogrupos e seus respectivos sub-

haplogrupos na África sul-saariana torna viável estudos filogeográficos utilizando

como marcadores de linhagem os subgrupos de E*. Nota-se, por exemplo, que

E1* é majoritariamente encontrado em alguns grupos na África Ocidental (não-

Bantu), enquanto E3b* é quase exclusivo de Bantus do Quênia e Tanzânia, o que

faz destes marcadores étnico-específicos.

Abre-se desta forma, uma nova perspectiva para averiguar a origem mais

precisa dos africanos que aqui chegaram. Deve ser salientado ainda que,

conjuntamente estes dois tipos de sistemas genéticos uniparentais (mtDNA e

cromossomo Y) fornecem informações complementares que podem alcançar

dezenas de gerações no passado, o que permite resgatar a história de um povo

por meio das migrações realizadas por mulheres e homens, respectivamente

(Pena e Bortolini, 2004). No caso específico deste trabalho estes marcadores

permitiram, pela primeira vez, traçar o perfil genético das mulheres e homens

africanos que contribuíram para a formação do povo brasileiro. Além disso, como

tem sido demonstrado recentemente (Bortolini e cols., 2004b) as populações sul-

americanas, particularmente as brasileiras, são um reservatório importante de

linhagens mitocondriais africanas, o que torna possível a investigação de eventos

demográficos e migratórios, protagonizado pelas mulheres, dentro do próprio

continente africano. O mesmo pode ser verdadeiro considerando os marcadores

do cromossomo Y. Desta forma, poderemos ter também a contrapartida

masculina no resgate de eventos importantes que fazem parte da história das

populações africanas, que não aparecem nos registros históricos.

II. OBJETIVOS

Este trabalho buscou caracterizar geneticamente com relação a dois tipos

de marcadores de linhagens, mtDNA (seqüenciamento da HVS-I) e marcadores

do cromossomo Y, que definem haplogrupos geográfico-específicos - Ameríndio:

Q*, Q3*; europeu e/ou asiático: P*, R*, K*, F*, J*, YAP (xDE), D*(xE); e sub-

saariano: E1*, E2*, E3a*, E3a1, E3a2, E3a4, E3a5,E3a6, E3a7, E3b*, E3b1*,

E3b2* E3b3, E3b4, E-V6, e B* - uma amostra de duzentas e setenta e sete

pessoas classificadas como negras (preto e pardo) de Porto Alegre e da cidade

do Rio de Janeiro, visando:

1- Comparar os resultados obtidos considerando as duas amostras

(brasileiros negros e africanos) aqui avaliadas e aqueles disponíveis para

outras populações africanas.

2- Determinar a origem mais precisa dos escravos que aportaram no Brasil e

se houve diferenças étnico-genêro-específicas no tráfico do Atlântico Sul.

III. ARTIGO

Os resultados referentes a este trabalho encontram-se no manuscrito que

segue e que foi submetido para a revista Annals of Human Genetics. Detalhes

sobre os métodos utilizados e resultados adicionais (que não figuram no mesmo)

encontram-se no apêndice e anexo, respectivamente. A formatação do texto está

de acordo com as normas exigidas pela revista a que foi submetido.

Are There Geographic Gender Specific Differences in the Atlantic Slave Trade?

Brazil as a Test Case

HÜNEMEIER T

, CARVALHO CM

MARRERO AR

SALZANO FM

PENA SDJ

AND

BORTOLINI

Departamento de Genética, Instituto de Biociências, Universidade Federal do Rio

Grande do Sul, caixa Postal; 15053, 91501-970 Porto Alegre, RS, Brazil

Departamento de Bioquímica e Imunologia, Universidade Federal de Minas Gerais,

31270-901 Belo Horizonte, MG, Brazil

RUNNING HEAD: mtDNA/Y-chromosomes in Brazilian Black populations

Key words: mtDNA, Y-SNP, Brazilian Black populations, Atlantic Slave Trade

Correspondence: Dr. Maria Cátira Bortolini, Departamento de Genética, Instituto de

Biociências, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Caixa Postal 15053, 91501-

970 Porto Alegre, RS, Brazil. E-mail: [email protected]

SUMMARY

A total of 213 Black individuals from two Brazilian cities (Rio de Janeiro and Porto

Alegre) were studied in relation to the mitochondrial DNA hypervariable segment 1 (HVS-

I) sequences and the results compared with those from 21 African groups. A subset of 187

males of the sample was also characterized for 30 biallelic polymorphisms, and the data

compared with those from 48 African populations. The mtDNA data provided indication

that 69% and 82% of the matrilineages found in Rio de Janeiro and Porto Alegre originated

from Central-West/South Africa, respectively. This is in close agreement with historical

records that show that most of the Brazilian slaves that arrived in the Rio de Janeiro port

were from Central-West Africa. In contrast to mtDNA, Y-chromosome haplogroup

analysis did not allow discrimination between places of origin in West and Central-West

Africa. Thus, when comparing these two major African regions, there seems to be higher

genetic structure with mtDNA than with Y-chomosome data, suggesting a higher migration

rate of the Niger-Congo speaking males than females.

INTRODUCTION

From the fifteenth to the nineteenth century about 10 million Africans were brought

to America as slaves, ∼40% of them to Brazil (Klein, 2002). Most of these were men, since

it was supposed that they would be more able to support the hard work in the farms and

mineral mines. Furthermore in Brazil it would be cheaper to import slaves directly from

Africa than to invest in the “in loco slave reproduction”, since infant mortality was very

high, reaching 88% in some Brazilian regions (Bergmann, 1977; Conrad, 1985).

Additionally, the slave trade to Middle East preferentially involved sub-Saharan women,

and this resulted in a relatively reduced number of available slave women plus an increased

price for them (Klein, 2002). This forced massive and asymmetrical migration had a tragic

impact in some African societies and determined that part of their history had to be written

outside Africa.

The Africans that were brought to Brazil as slaves originated mainly from Central-

West/Southeast Africa and West Africa. This region has continental dimensions and is

populated by very distinct peoples and cultures. There is, however, a relatively linguistic

unity since it is inhabited by speakers of languages identified within the Niger-Congo

linguistic subphylum (a classical exception in West Africa is the Hausa, who speak an

Afro-Asiatic family belonging the Chadic branch; Greenberg 1963; Ruhlen 1987). Within

the Niger-Congo branch Bantu languages are now spoken in virtually all Central-South

Africa (about 100 million of speakers), except for the area occupied by the Khoisan-

speaking groups. The location of the Bantu origins has been identified as most likely being

between Cameroon and Nigeria (Newman, 1995). The Bantu expansion age (3,400 ± 1,100

years before present, BP; Zhivotovsky et al., 2004) coincided with the end of the Neolithic

and was apparently related to the diffusion of agriculture and iron metallurgy (Phillipson,

1993, Diamond and Bellwood, 2003; Plaza et al., 2004). In contrast, in the West African

branch of the Niger-Congo subphylum, the native inhabitants speak several non-Bantu

languages (Greenberg, 1963; Ruhlen, 1987; Cavali-Sforza et al., 1994). Genetic studies

have demonstrated that Niger-Congo speaking populations are more related to each other

than to other Africans. These same investigations have also shown that Bantu speakers

show a higher level of genetic homogeneity than the non-Bantu populations (Cavalli-

Sforza et al. 1994; Poloni et al. 1997; Salas et al. 2002, 2005; Wood et al. 2005).

Since the historical records about slavery contain many gaps, genetic studies with

South Americans descendant of Africans have provided data that were used to rescue part

of the trajectory of these Niger-Congo speakers out of Africa. In the extensive review

about this matter presented by Salzano and Bortolini (2002) it is possible to verify that

61%, 34% and 3% of the Hb

haplotypes found in Brazil as a whole are of the types

named Bantu, Benin and Senegal, respectively. These results are in good agreement with

the historical sources which indicate that ~68%, and ~32% of slaves were brought from

Central-West/Southeast and West Africa, respectively (Klein, 2002).

Recently, lineage markers (mitochondrial DNA –mtDNA- and the non-recombining

portion of the Y-chromosome) have been used to try to unravel the history of human

populations, since they are uniparentally transmitted, and escape recombination. These

markers allow the reconstruction of unequivocal haplotype phylogenies, which can be

related to geographic distributions, in an approach known as phylogeography (Avise,

2000).

Salas et al (2002) carried out a thorough phylogeographic analysis of the African

mtDNA haplogroup variability. They showed that Africa presents a genetic picture, that is

more complex than that of any continent, with a time depth for mtDNA lineages further

than 100,000 years. In this same work the authors also identified a new African haplogroup

(L3g, recently renamed as L4g; Kivisild et al. 2004), which is frequent in Tanzania and

Kenya (Salas et al. 2002). The presence of this haplogroup in South America (Colombia

and Brazil) was interpreted as either a result of the direct slave trade from eastern Africa or

to undetected gene flow from eastern Africa into western or southwestern Africa, before its

introduction into America. Bortolini et al. (2004a) evaluated this proposal, and from the

identification of L3g in several Cameroon ethnic groups and in other Brazilian populations,

concluded that the L3g lineages, after an origin in eastern Africa, was carried by

transcontinental gene flow, after the major Bantu expansion, into Cameroon. The

American L3g lineages, on the other hand, probably have their immediate origin in

Cameroon or in neighboring regions and not directly from eastern Africa. On the basis of

the extensive amount of new data that could be added to the L3g phylogeny, Salas et al.

(2004b) corroborated this proposal.

Alves-Silva et al. (2000) furnished an initial landscape about the phylogeography of

the African mtDNA haplogroups in Brazil as a whole. Haplogroups L3e and L1c together

constituted approximately 49% of the African fraction of sequences identified by these

authors. These results suggested that the majority of the mtDNA lineages of African

ancestry in their Brazilian sample would have a Bantu origin (Central-West Africa, with a

minor contribution from the Southeast), although a substantial number could also have

come from West Africa trough non-Bantu carriers. The authors also predicted the probable

mtDNA haplogroup composition of populations from African regions hitherto not studied,

like Angola/Congo.

From the above a picture emerges of contemporary Brazilian population

representing an extraordinary reservoir of African mtDNA lineages (an estimate suggested

that ~90 million people, independently of their physical appearances, present mtDNAs of

African origin; Pena and Bortolini, 2004). This fact allowed inferences not only about the

Atlantic slave trade history, but also of possible evolutionary and demographic events

mediated by women that should have occurred in Africa (Bortolini et al. 1997; Alves-Silva

et al. 2000; Bandelt et al. 2001; Bortolini et al. 2004a).

Salas et al. (2004a) estimated for the first time the quantitative contribution of the

different African regions to the formation of the New World mtDNA gene pool: 65% of

the types found in South America would have a Central-West African origin, its

complementary value indicating a West African contribution. These numbers are

particularly different from those obtained for Central America (41% Central-West, 59%

West), and North America (28% Central-West, 72% West), in agreement with the

historical data of these regions. Using the same kind of approach but substantially more

data, Salas et al. (2005) estimated that > 55% of the U.S. lineages have a West African

ancestry, with < 41% coming from Central-West or Southwestern Africa, results which are

close to the historical record.

A most recent investigation with Brazilian populations using mtDNA-HVS-I data,

however, has yielded discrepancies between the patterns obtained with the major mtDNA

haplogroup distributions and the historical sources (Silva-Jr et al., 2006). This raised the

suggestion of a possible geographical-gender specific difference, with a proportionally

larger number of West-African men than women compulsory migrating to Brazil (Silva-Jr

et al., 2006). Klein (2002) presented data related the slave origin, by sex, in state of São

Paulo between 1777 and 1829. The numbers presented there show that of the total of slaves

with a West origin, 72% and 28% were men and women, respectively, whereas of the total

of slaves with Central-West origin these values are 67% and 33%. Although these numbers

based on historical registers should be considered with caution, since are related only with

a particular region during relatively short period, they are significantly different (χ

63,6; P < 10

-4

), showing the possibility of geographic gender specific differences

(proportionally more West African men than West African women when compared with

Central-West men/women) in the Atlantic slave trade to Brazil.

The investigation of paternally inherited geographical-specific African Y-

chromosome haplogroups is an obvious extension necessary to provide a more complete

picture about this and other questions related to the Atlantic slave trade to Brazil and to

other American countries.

Several studies of Y-chomosome phylogeographical landscape in Africa are

available (Cruciani et al. 2002, 2004, Luis e cols. 2004, Beleza et al. 2005, Wood et al.

2005), but hitherto no investigation has evaluated the same set of markers in males from

the three Americas.

Here we provided information about the distribution of the mtDNA and Y-

chromosome haplogroups in two Brazilian Black populations, and compared these results

with those published for populations of several African regions. The implications derived

from the simultaneous consideration of these two sets are then presented, not only in

relation to the nature of the Atlantic slave trade to Brazil but also regarding events that

should have occurred in Africa.

MATERIAL AND METHODS

Populations

Samples of 213 individuals classified as Black according their physical appearance

and originating from two Brazilian cities: Rio de Janeiro (N=94), the capital of Rio de

Janeiro state, and Porto Alegre (N= 109) the capital of Rio Grande do Sul, the

southernmost state of Brazil. Rio de Janeiro, plus the northeastern cities of Salvador (state

of Bahia) and Recife (state of Pernambuco) were the most important ports of arrival of

slaves in Brazil. From these centers the slaves would be distributed to the other provinces,

including Rio Grande do Sul.

mtDNA

The nucleotide sequence of the first hypervariable segment (HVS-I) of 213

individuals was amplified and sequenced according to conditions described in Marrero et

al. (2005). Both strands of DNA were sequenced.

The sequences were checked manually, validated with the help of the CHROMAS

LITE 2.0 program (www.technelsyum.com.au) and aligned with the revised Reference

Sequence (rCRS, Andrews et al., 1999) using the BIOEDIT software (Hall, 1999). Since

artifacts (“phantom mutations”) can be introduced during the sequencing and editing

process, we applied the filtering procedure described by Bandelt et al. (2002) and used

criteria like those of Yao et al. (2004) to check for the quality of the sequences. After

filtering a network of sequences was constructed with the NETWORK 4.1.1.2. program

(www.fluxus-engineering.com) using the median-joining algorithm. Weight networks

showing perfect star tree patterns are expected when the data are potentially free of

phantom mutations. However, other criteria as phylogenetic analysis in comparisons with

closely related sequences from other databases must be observed to guarantee the quality

of the data (Yao et al., 2004).

Y-chromosome markers

The male fraction of our sample (N = 187) was also studied for thirty biallelic Y-

chromosome polymorphisms (92R7, M9, M3, M19, M242, RPSY711, M17, M173,

SRY2627, PN2, M2, M174, M145, M33, M35, M75, M58, M191, M149, M116.2, M10,

M78, M154, M155, M281, M123, M81, M213, M60, V6) using hierarchical strategies plus

RFLP and mini-sequencing methods as described in Bortolini et al. (2003) and developed

by Carvalho and Pena (2005), respectively. These markers define the major European,

Amerindian and African haplogroups, but resolve especially well E African Y-SNP

haplogroup.

RESULTS AND DISCUSSION

Ninety percent and 78% of the mtDNA sequences found in Rio de Janeiro and

Porto Alegre, respectively, are estimated as having an African origin. These numbers are

larger than those obtained for populations identified as White of different Brazilian

regions, where the proportion of African mtDNA lineages ranged from 0 to 44% (Alves-

Silva et al., 2000; Marrero et al., 2005). Table 1 furnishes the mtDNA haplogroup

distributions for the two Brazilian Black samples and for 21 African populations. About

70% of the haplogroups present in these African groups can be seen also in Brazil, while

all haplogroups observed in these two Brazilian Black samples can be found in Africa.

Table 1 also shows that there are similarities of haplogroup frequencies between the West

and Central-West regions of Africa in comparison with other major regions of continent

(Salas et al., 2005), probably reflecting genetic similarity within the Niger-Congo linguistic

subphylum. Some haplogroups, however, are present only in Central-West and/or

Southeast Africa (L3e1a, L5a1, L0d, L0d1, L0d2), whereas others seem exclusive to

West Africa (L2a-α2, L2c1, L2d2, L3b1). Many haplogroups show striking differences in

their distributions; for example, the cumulative frequency of L1b1 in West (12.3%) is

about 7 fold larger than that found in Central-West/Southeast Africa (1.7%). Ancient or

more recent (but not less complex) demographic events have been related to these

particular mtDNA haplogroup distributions across Africa (Salas et al., 2002).

Of special interest is the presence of haplogroup L0d1 in Rio de Janeiro. This and

other related haplogroups (L0d, L0d2) are characteristic of southern African Khoisan-

speaking groups, but are also present in Mozambique, probably due to admixture between

Khoisan women and Bantu Southeast men (Salas et al., 2002). The occurrence of this

haplogroup in Brazil, therefore, may reflect the direct slave trade from Mozambique.

Using the distributions of haplogroups presented in table 1 we constructed a

cladogram with a topology in which it is possible to see three well defined clusters (fig 1).

One of them groups (A) all West Africans; another (B) clusters the Central-West/Southeast

Africans plus the two Brazilian Black populations. Note the proximity of the latter with the

two former Portugal colonies, Angola and Mozambique, and the smaller geographical

cluster inside these two major clusters. One third, intermediate and more restrict cluster

(C), is represented by three populations from Cameroon (Bassa, Bakaka and Fulbe).

Cameroon is geographically located in the probable center of spread of the Bantu

languages and is exactly between Western and Central-Western Africa regions. As

consequence it contains both Bantu (like Bakaka and Bassa) and non-Bantu speaking

populations (Fulbe). Figure 1 suggests genetic differentiation within the Niger-Congo sub-

phylum, separating the Central-West/Southeast Bantu speakers (Fang, Cabinda, Bubi,

Angola, Mozambique) from the Western non-Bantu speakers (Yoruba, Kanuri, Fulbe,

Shongai, Senegalese, Limba, Temne, Mende, Loko, Wolof, Mandenka, Serer). Using an

analysis of molecular variance (AMOVA), implemented in the program Arlequin v. 2000

(Excoffier et al., 1992), we tested the hypothesis of differentiation between these two

major geographical groups (excluding the Brazilian samples) and the value obtained,

although low, is significant:

= 0.025, P < 10

-4

. These two major population groups

were then used as parental stocks in the admixture, as shown in Table 2. The admixture

values obtained for RJ and POA are similar than those suggested by the historical records.

Preliminarily, these findings can reflect the absence of any major geographic gender-

specific differences in the Atlantic slave trade at least in relation to these two cities.

According to Berute (2004) 88% of the Rio Grande do Sul slave population was brought

from Rio de Janeiro (the complementary number of slaves were brought from other

Brazilian provinces and Uruguay and not directly from Africa; Maestri-Filho, 1993;

Berute, 2004).

Table 3 shows that 56% and 36% of the Y-chromosome from Rio de Janeiro and

Porto Alegre respectively appear to have an African origin. The values are much higher

than those obtained for Brazilian population identified as White (0 to ~5%; Carvalho-Siva

et al., 2001; Abes-Sandes et al., 2004; Marrero et al., 2005). E3a* is the most frequent

African haplogroup in Brazilian, followed by E3a7. With the exception of E3b2, all

African haplogroup E chromosomes found in Brazil are also present in sub-Saharan

Africans. E3b2 has been described in high frequencies in North African populations,

particularly among the Berber (Cruciani et al., 2002; Luis et al., 2004; Semino et al., 2004).

One of the most important population movements relating both sides of the Mediterranean

region was the conquest of the Iberian Peninsula by North Africans (basically Berbers who

were recruited by Muslim people coming from Arabia; Lucotte et al., 2001). The

occupation lasted ~7 centuries and typical Berber Y-chromosomes, have been reported in

Portuguese/Spanish populations (Carvalho-Silva et al., 2001; Lucotte et al. 2001; Bortolini

et al. 2004b; Cruciani et al. 2004; Semino et al. 2004; Gonçalves et al. 2005). Then, the

presence of this haplogroup in Brazil, is probably related to Iberian men.

Since few African populations have been studied with the same set of Y-SNPs used

here, we assembled the haplogroups according to a hierarchical strategy. This procedure

allowed the comparison of our results with those from 48 African populations, including

36 Niger-Congo speaking groups (table 4).

We used the frequency of the Y-chromosome haplogroups in Brazilians and

Africans to obtain a distance matrix and used it to construct a neighbor-joining tree

(Figure 2), which shows a clear split separating the Niger-Congo speakers (cluster B) from

the other Africans (Afro-Asiatic and Nilo-Saharan speakers; cluster A). But there are some

exceptions (Massai and Luo populations from Kenya clustered together with Niger-Congo

speakers, whereas Mixed-Adamawa, Fulbe-Cameroon and Tupuri grouped with the Afro-

Asiatic speakers). The two Black Brazilian populations are closely related to each other

and with the Niger-Congo speaking-populations. The Niger-Congo cluster, however, does

not show internal structure in accordance with geography or language, differently of the

mtDNA findings. The same tendency was observed when just Niger-Congo populations

were considered in the analysis (data not shown). Using the populations from West and

Central-West/Southeast Africa given in table 4 (excluding those from Cameroon, see

commentary above) we obtained a value of

= 0.006; P > 5%, i.e., no Y-chromosome

differentiation between Central-West/South (Bantu) and West (non-Bantu) men. Cruciani

et al. (2002) preliminarily evaluated this situation and concluded that this absence of

differentiation is due to relatively recent range expansion(s). E3a* chromosomes were

already present across the Western region and spread to South Africa through of the Bantu

expansion. This haplogroup was also observed in high frequencies among hunter-gatherer

communities, Pygmies and Khoisan-speaking people, probably due to admixture between

Bantu men and Pygmies/Khoisan women. The M191 mutation, which defines haplogroup

E3a7, probably arose in Central-Western Africa. A later demic expansion should have

brought E3a7 chromosomes from Central-Western to Western Africa (Cruciani et al.,

2002).

An implication of these findings is that E3a* should be interpreted as a Niger-

Congo marker. Although the presence of E3a* in Central to South Africa can be associated

to Bantu expansion, the origin of this haplogroup is previous to the coalescence age of the

Bantu languages (Scozzari et al., 1999). Probably, E3a* was the most common

chromosome in the West Africa when arose the Niger- Congo language. A second

implication is that these important demic expansions in Africa, including the Bantu

dispersion, did not involve a higher migration rate of Niger-Congo speaking women than

men, but probably the opposite, or at least the same female/male migration rate.

Seielstad et al (1998) suggested that due mainly to the widespread practice of

patrilocality (in which women move into their husband´s residences after marriage) the rate

of human migration among populations is nearly eight times higher for females than males.

Mesa et al (2000), however, demonstrated that this is not universal and these findings were

later corroborated (Wilder et al., 2004). Actually, Hammer et al. (2001) suggested that sub-

Saharan Africans might represent a case in which the genetic structure of human

populations has been shaped by a greater male mobility. Of course, the absence of a signal

of a higher migration rate among population for females than males in a global scale does

not contradict the evidence for patrilocally effects at local scales (Wilder et al., 2004),

which have been described in several agriculturalist sub-Saharan groups (Destro-Bisol et

al., 2004). As a whole, these results suggest a possible scenario where men mediated the

major migration events related with the Niger-Congo speaking populations. After of the

fixation of these agriculturalist populations, particular social behaviors (patrilocally, for

example) probably might have been established.

Finally, we can infer from these results that it is impracticable to make finer

admixture analyzes using the Y-SNP haplogroups and parental groups considered here and

in other investigations with mtDNA data set (Salas et al., 2004a, 2005). Additional studies

with Y-SNPs associated with fast-evolving genetic system as the Y-STR loci in a large

African sample might better discriminate particularly the E3a* and E3a7 chromosomes and

help to solve the complex dynamics of these migrations inside Africa. As consequence, we

could also define with more accuracy the nature of the Atlantic slave trade to Brazil and to

other American countries.

Acknowledgments

We thank Dr. M.H. Hutz (Universidade Federal do Rio Grande do Sul), and Dr. E.

Bandinelli (Universidade Federal do Rio Grande do Sul) for the Porto Alegre and Rio de

Janeiro samples, and Rafael Bisso Machado for technical assistance. We would also like to

thank Dr. Sídia Callegari-Jacques (Universidade Federal do Rio Grande do Sul) for her

constructive comments. This investigation was approved by the Brazilian National Ethics

Commission (CONEP number 1333/2002).This research was supported by grants from

CNPq (Universal, PRONEX, Milênio) and FAPERGS (BIC).

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Appendix I

Table1.Major Sub-Saharan African mtDNA Haplogroups and their Distributions in two Brazilian and Twenty-one African Populations

Brazil

Africa

Haplogroups

Niger-Congo speakers

Afro-Asiatic

speakers

Central-West Southeast West

POA

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20

L0 022 0.

L0a

056 07

0.006 0.125 0.033 0.018

L0a1 0.059

0.070 0.045 0.111

0.068 0.023 0.022 0.097 0.018 0.033 0.015 0.051

L0a2 0.047 0.068

0.111 0.029 0.111 0.177

L0d 0.038

L0d1 0.011 0.013

L0d2 0.003

L1b 0.012 0.094 0.045

0.020 0.006 0.026 0.067 0.048 0.027 0.027 0.075 0.100 0.046 0.017

L1b1 0.036

0.111 0.010 0.066 0.067 0.129 0.006 0.100 0.102 0.125 0.135 0.024 0.210 0.163 0.178 0.205 0.133 0.015 0.103 0.067

L1c 0.047 0.111 0.029 0.064 0.003 0.067 0.026

L1c1 0.070 0.047 0.045 0.028

0.111 0.098 0.067 0.111 0.019 0.125 0.033 0.048 0.018 0.068 0.046 0.043

L1c2 0.059 0.070 0.093 0.111

0.126 0.088 0.133 0.032 0.019

L1c3 0.047 0.023

0.028 0.010 0.013

L2 0.023

0.022

0.165

L2a- α1 0.023 0.045

0.020 0.006 0.200 0.051 0.033 0.027 0.054 0.018 0.033

L2a-α2 0.023 0.022 0.032 0.024 0.054 0.100 0.031 0.043

L2a- α3 0.010 0.052

0.027 0.037 0.068 0.077 0.043

L2a1a 0.047 0.059 0.068

0.091 0.100 0.026 0.125 0.033 0.024 0.067

L2a1b 0.129 0.018

L2a1- β1 0.118 0.117 0.023 0.222

0.010

0.066 0.044 0.031 0.051

0.100 0.024 0.158 0.108 0.036

0.111 0.033 0.077 0.008

L2a1-β2 0.012 0.011 0.045 0.023

0.111

0.064

0.010 0.067 0.048 0.052

0.081 0.018 0.033

0.046

0.051 0.067

L2a1-β3 0.023 0.068 0.010 0.013 0.102 0.125 0.033 0.071 0.027 0.009 0.018 0.034 0.196

L2b 0.070

0.023 0.045

0.028

0.010 0.023

0.022 0.032 0.013

0.071 0.081 0.018

0.033

0.015

L2b1 0.047 0.059 0.044 0.032 0.033 0.048 0.215 0.108 0.027 0.031 0.008

L2c 0.023 0.051 0.071 0.052 0.027 0.293 0.037 0.124 0.120 0.067

L2c1 0.027 0.062 0.017

L2c2 0.020 0.006 0.024 0.027 0.018 0.033 0.062 0.017

L2d1 0.194 0.010 0.048 0.026 0.067

L2d2 0.100 0.081 0.056 0.033 0.015 0.034

L3 0.012 0.011 0.132 0.180 0.193 0.013 0.037

L3b 0.047 0.035 0.023

0.039

0.023

0.022

0.064 0.025

0.100

0.051 0.250

0.165 0.054

0.027 0.094 0.100

0.124 0.094 0.067

L3b1 0.032 0.102 0.033 0.071 0.105 0.027 0.018 0.046 0.008 0.067

L3b2 0.023 0.032

0.009 0.067

L3d 0.023 0.023 0.023 0.010 0.025 0.200 0.102 0.133 0.024 0.054 0.045 0.056 0.033 0.046 0.068 0.067

L3d1 0.012

0.011 0.023

0.010 0.038 0.051

L3d2 0.047 0.010 0.024 0.052 0.036 0.018 0.100 0.015 0.043

L3d3 0.023 0.030 0.003 0.026

L3e1 0.047 0.023 0.068 0.083

0.049 0.088 0.089 0.028 0.033 0.031

L3e1a 0.070

0.011 0.045

0.039 0.038

L3e1b 0.011 0.028 0.039 0.028

L3e2 0.023 0.023

0.250 0.111 0.078 0.044 0.129 0.010 0.100 0.157 0.100 0.024 0.054 0.009 0.015 0.008 0.067

L3e2b 0.023 0.023 0.

L3e3 0.047 0.07 0.068

0.028 0.020 0.066 0.022 0.038 0.067 0.052 0.009 0.067

L3e4 0.010 0.088 0.024 0.052

0.027 0.036 0.077

L3f 0.036 0.023 0.023

0.334 0.137 0.023 0.067 0.025 0.100 0.128 0.125 0.067 0.095 0.067

L3f1 0.047 0.023 0.010 0.056 0.046 0.060

L3g (L4g) 0.036 0.045 0.010 0.023 0.018

L5a1 (L1e)

0.023

POA: Porto Alegre, N= 85; RJ : Rio de Janeiro, N= 85.

The numbers correspond to the following African populations: 1-Angola, N=44, Plaza et al. (2004); 2- Bubi, N=36 (Equatorial Guinea) Mateu et al. (1997);

3-Fang, N=9 (Equatorial Guinea), Pinto et al. (1996); 4-Cabinda, N= 101 (Cabinda, former Portuguese protectorate), Beleza et al. (2005); 5- Bakaka, N=44

(Cameroon), Coia et al.. (2005); 6-Bassa, N= 45 (Cameroon), Coia et al. (2005); 7- Fulbe, N= 31 (Cameroon), Coia et al. (2005); 8- Mozambique, N=307

Salas et al. (2002); 9- Kanuri, N=10 (Niger, Nigeria), Watson et al. (1997); 10-Fulbe, N= 39 (Nigeria, Niger, Benin, Cameroon, Burkina Faso), Watson et al.

(1997); 11-Songhai, N=8 (Nigeria, Niger, Mali), Watson et al.. (1997); 12-Yoruba, N= 30 (Nigeria), Watson et al. (1997), Vigilant et al. (1991); 13-

Senegalese, N= 42 (Senegal), Rando et al. (1998); 14- Serer, N= 19 (Senegal), Rando et al. (1998); 15-Wolof, N= 37 (Senegal), Rando et al. (1998); 16-

Mandenka, N= 112 (Senegal), Graven et al. (1995); 17- Mende, N=54 (Sierra Leona), Jackson et al. (2005; 18- Loko, N=30 (Sierra Leone), Jackson et al.

(2005); 19- Limba, N=65 (Sierra Leone), Jackson et al. (2005); 20- Temne, N=117 (Sierra Leone), Jackson et al. (2005); 21-Hausa, N=15 (Niger, Nigeria),

Watson et al. (1997).

Table 2 Origin of Slaves (in %) who Arrived in Rio Grande do Sul and Rio de Janeiro at the Time

of Slave Trade Considering Genetic and Historical Sources

Central-West and South Africa

West Africa

Porto Alegre (POA)

mtDNA

82 ± 14 18 ± 14

Y-SNP ND

Historical

~80 ~20

Rio de Janeiro

mtDNA

69 ± 13 31 ± 13

Y-SNP ND

Historical

~70 ~30

Major geographical regions characterized by the presence of people who speak languages

identified with the Bantu branch, Niger-Congo subphylum. Two important previous Portuguese

colonies were located in this region: Angola and Mozambique.

Major geographical region characterized by the presence of people who speak languages identified

with several non-Bantu linguistic groups of the Niger-Congo subphylum (except Hausa, see text).

Since the majority of the Sub-Saharan mtDNA haplogroups are not geographic-specific, the

estimates of the African contributions were obtained using the frequencies presented in Table 1

and Long´s (1991) least square method. Some sub-clades with low frequencies in the derived

populations (RJ and POA) were grouped in their respective major clades.

According to Maestri-Filho (1993).

ND: Not determined because there is not enough genetic differentiation in these two major

parental African regions considering the Y-SNP data set used in this study (see text).

According to estimates presented by Klein (2002).

Table 3. Distributions ( in %) of the B*, D* and E* Y-Chromosome Haplogroups in two Brazilian and Twenty-one African populations

Haplogroup

BRAZIL

AFRICA

Niger-Congo speakers Nilo-

Saharian

speakers

Afro-Asiatic

speakers

Central-West Central-West Central-West

POA RJ 1 3 4 6 7 8 10 11 12 14 17 18 20 21

E3a* (M2) 33 68 52 38 26 46 17 25 59 57 21 21 22 11 7 28

E3a1 (M58) 5 10

E3a2 (M116.2)

ND ND ND ND ND

E3a4 (M154)

ND ND ND ND ND

E3a5 (M155)

ND ND ND ND ND

E3a6 (M10) 11

9 12 57 21 33 25 56 21 31 51 48 22

E1* (M33) 5 10 53 20

E2* (M75)

2 27 5 17 8 4 11 22

E3b* (M35)

West

Central-East

2 5 9 13 15 16 19

E3* (PN2) 3 6

16 90 66 67 32

ND ND

E3a3 (M149)

ND ND

7 2

E3a7 (M191)

22 8 20 41 19 7

4 2

3 4 2 14 37 3 1

E3b1*(M78) 3 6

2 1

E3b3 (M123)

E3b4 (M281)

ND ND ND ND

E3b2* (M81)

ND ND ND ND ND ND ND ND ND ND

E-V6

ND ND ND ND ND ND ND ND ND ND ND ND ND ND ND ND ND ND ND ND ND

YAP(xDE) (M145)

D* (xE) (M174)

B* (M60) 3 1 2 10 18 12 4 3 22 7 5

Others

64 44 41 3 23 7 60 22 14 19 6 15 34 72 44 95

ND = not determined (Marker did not investigate).

Nomemclature according the The International Y – Chromosome Consortium (2002).

RJ= Rio de Janeiro (N=130) POA= Porto Alegre population (N=57). Present study.

The numbers correspond to the following African populations: 1-Mossi, N=49 (Burkina Faso); 2-Rimaibe, N=37 (Burkiina Faso); 3-Fulbe, N=20 (Burkiina Faso);

4- Fon, N=100 (Benin); 5- Fulbe, N=17 (Cameroon); 6- Ewondo, N=29 (Cameroon); 7-Fali, N=39 (Cameroon); 8- Tali, N=15 (Cameroon); 9- Mixed Adamawa,

N=18 (Cameroon); 10- Bakaka, N=12 (Cameroon); 11- Bamileke , N=48 (Cameroon); 12- Bamileke, N=85 (Cameroon); 13- Bantu, N=14 (Cameroon); 14- Bantu,

N=29 (Kenya ); 15- Wairak, N=43 (Tanzanya); 16- Hutu, N=69 (Ruanda); 17- Tutsi, N=94 (Ruanda); 18- Mixed-Nilo-Saharian, N=9 (Cameroon); 19- Mixed-

Chadic, N=15 (Cameroon); 20- Daba, N=18 (Cameroon); 21-Ouldeme, N=21 (Cameroon). African data compiled from Cruciani et al. (2002); Luis et al. (2004).

This haplogroup has been described with distributions ranging from 4% to 17% in populations from Kenya and Ethiopia (Cruciani et al. 2004).

Table 4.Distributions (in %) of the B* and E* Y-Chromosome Haplogroups in two Brazilian and in forty-eight African populations

Population (country)

Haplogroup

E3*(xE3a) E3a *(xE3a7)

E3a7

(M191)

E1*

(M33)

E2*

(M75)

E3b* (xE3b1,xE3b2)

E3b1*

(M78)

E3b2*

(M81)

(M60)

Others

Porto Ale

(

Brazil

)

57 16 9 3 3 2 3 64

Rio de Janeiro (Brazil)

130

34 12 2 2 4 1 1 44

Niger

Congo speakers

West

Wolof (Gambia/Senegal)

3 68 12 3 6 6 2

Mandinka (Gâmbia/Senegal)

79 3 5 3 3 7

Ewe (Ghana)

3 73 23 1

Ga (Ghana)

62 34 3 1

Fante (Ghana)

3 44 41 3 3 6

Fon (Benin)

100

38 57 5

Mossi (Burkina Faso)

2 68 22 4 2 2

Rimaibe (Burkiina Faso)

3 57 8 5 27

Fulbe-I (Burkiina Faso)

90 10

Central-West

Mixed-Adamawa (Cameroon)

28 12 60

Fali (Cameroon)

26 33 18 23

Tali (Cameroon)

53 20 20 7

Fulbe-II (Cameroon)

6 53 41

Tupuri (Cameroon)

11 89

Ewondo (Cameroon)

66 21 10 3

Bakaka-I (Cameroon)

75 25

Bakaka-II (Cameroon)

47 53

Bamileke-I

40 56 4

Bamileke-II

59 41

Bantu (Cameroon)

57 21 22

Bassa (Cameroon)

55 36 9

Ngoumba (Cameroon)

39 32 6 23

Cont. table 4

Nande (Democratic Republic of Congo)

33 37 30

Hema (Democratic Republic of Congo)

17 11 39 28 5

Cabinda(Democratic Republic of Congo)

46 32 ND ND ND ND ND

9 13

Cont.

Central

East

Bantu (Kenya)

21 31 17 14 3 14

Wairak (Tanzanya)

22 19 2 37 20

Hutu (Ruanda)

32 51 8 3 6

Tutsi (Ruanda)

32 48 4 1 15

Ganda (Uganda)

31 46 16 7

South-Wes

Herero (Namibia)

38 33 29

Ambo (Namibia)

5 50 32 5 5 3

South-East

Shona (Zimbabwe)

51 37 2 10

South

Sotho-Tswana (South África)

4 36 21 4 7 18 10

Zulu (South África)

3 34 21 21 17 4

Xhosa (South África)

4 34 20 28 5 5 4

Nilo

Saharian speakers

Central-Wes

Mixed (Cameroon)

11 22 11 22 34

Central-Eas

Massai (Kenya)

12 4 35 15 8 26

Luo (Kenya)

22 44 22 12

Afro

Asiatic speakers

Central-Wes

Mixed-Chadic (Cameroon)

7 7 7 79

Podokwo (Cameroon)

5 95

Cont. table 4

Mandara (Cameroon)

11 4 7 4 74

Uldeme (Cameroon)

31 69

Ouldeme (Cameroon)

5 95

Daba (Cameroon)

28 22 6 44

Central-Eas

Amhara (Ethiopia)

6 11 33 50

Mixed Semitic (Ethiopia)

10 20 35 35

Oromo (Ethiopia)

11 11 22 56

ND = non determined (Marker did not investigate).

Nomemclature according to he International Y – Chromosome Consortium (2002).

Data of the African populations were compiled from Cruciani et al. (2002), Luis et al. (2004), Wood et al. (2005), Beleza et al. (2005) .

Appendix II

Figure 1

Unrooted tree based on mtDNA haplogroup distributions present in table 1, using D

distance (Nei et al.,1983). The tree was obtained using the neighbor-joining methods

(Saitou and Nei, 1987) and the TREEVIEW package

(

http://taxonomy.zoology.gla.ac.uk/rod/rod.html

A: Western non-Bantu cluster; B: Central-West/Southeastern Bantu cluster;

C: Cameroon populations;

Figure 2

Unrooted tree based on Y-SNP haplogroup distributions present in table 4, using D

dis0tance (Nei et al., 1983). The tree was obtained using the neighbor-joining methods

(Saitou and Nei, 1987) and the TREEVIEW package

(

http://taxonomy.zoology.gla.ac.uk/rod/rod.html

). Since all “other” haplogroups in Rio de

Janeiro and Porto Alegre had an European or Amerindian origin, this category was

excluded of the analyses for these two populations.

A: Afro-Asiatic speaker cluster; B: Niger-Congo speaker cluster.

igeria and

neighboring

countries

Sierra Leone

Senegal

Cameroon

Equatorial

Guinea,

Cabinda

Former

Portuguese

colonies

Fig. 1

Fig. 2

IV. DISCUSSÃO

As discussões pertinentes e relativas ao objetivo principal deste trabalho

foram feitas de forma concisa no artigo. Desta forma, nesta seção pretende-se

conduzir uma discussão mais detalhada particularmente relativa as linhagens de

origem não-africana, tanto do mtDNA quando do cromossomo Y, encontradas nas

duas populações negras estudadas neste trabalho.

O Brasil é um país recente, com uma história de colonização diferenciada

dependendo da região do país. No entanto, genericamente, pode-se dizer que a

população brasileira originou-se basicamente a partir do encontro de três grandes

grupos geográficos: europeu, principalmente indivíduos vindos de Portugal;

africano, resultado do tráfico negreiro; e a população nativa, cuja presença na

América e no país antecede em milhares de anos a colonização africana e

européia (Bortolini e cols., 2003).

Esses grupos principais estão hoje representados de forma significativa,

através de seus genomas na população miscigenada (Bortolini e cols., 1997,

1999; Alves-Silva e cols., 2000; Carvalho-Silva e cols., 2001; Salzano e Bortolini,

2002; Marrero e cols., 2005). A população resultante do encontro destes grandes

grupos populacionais com seus distintos pools genéticos originou-se como

conseqüência de eventos demográficos, econômicos e sociais que vigoraram

durante longo período, numa época em que o Brasil figurava como uma

importante “colônia de exploração” do império português. As colônias de

exploração na América Latina caracterizavam-se ainda pela presença de uma

estrutura hierárquica bem característica. Os portugueses, na maioria homens no

primeiro século de colonização, formavam a classe dominante que dispunha não

só das riquezas da terra, mas também do povo nativo, que num primeiro

momento representavam quase a totalidade da mão de obra escrava. O rápido

desaparecimento da população ameríndia concomitante com a implementação do

mercantilismo colonial, resultou na importação de africanos para trabalharem

como escravos. Neste contexto, tanto os ameríndios quanto os escravos africanos

são sujeitos ao domínio europeu.

Em algumas regiões do país houve uma segunda onda de colonização

européia, mais recente, e que não visava a exploração dos bens naturais do país,

e sim a construção de nação. Surgem as chamadas “colônias de povoamento” no

Brasil. Nos séculos XVIII e XIX começam a chegar ao Brasil, principalmente à

região Sul, imigrantes europeus vindo principalmente de Portugal, Alemanha e da

Itália. Algumas cidades importantes no país são fundadas por esses imigrantes.

Juntam-se a eles os judeus no século XX, refugiados da II Guerra Mundial.

Pode-se dizer que Porto Alegre, fundada no século XVIII por imigrantes

açorianos, caracteriza-se mais como uma colônia de povoamente, enquanto o Rio

de Janeiro como uma colônia de exploração. Evidentemente estas atribuições as

duas cidades são um tanto quanto gerais, e devem ser consideradas com cautela.

Porém isto não impede que uma abordagem levando-se em conta estas

características seja considerada no momento em que os resultados obtidos com

os marcadores de linhagens são discutidos.

MtDNA

No Rio de Janeiro, o percentual de indivíduos identificados como negros

com ancestralidade materna africana é de 89,5%, enquanto em Porto Alegre é de

78% (Tabelas 2 e 3 do anexo). Esse fato se dá provavelmente pelos critérios de

classificação utilizados, pois ainda que os mesmos sigam um conjunto de

preditores, a análise é subjetiva e está dentro de um contexto sócio-cultural.

As populações de Porto Alegre e do Rio de Janeiro, quando comparadas

em relação às distribuições dos haplogrupos mitocondriais, utilizando-se o teste

exato de diferenciação de populações (Arlequin; Schneider e cols., 2000) não

apresentaram diferenças significativas (P = 0.023). Usando uma análise de

variação molecular (AMOVA) para comparar essas duas populações,

praticamente toda a variação encontrada é intrapopulacional (F

= 0.0044; P =

0.19).

Embora não tenha sido detectada diferenciação estatisticamente

significante entre as populações, alguns indicadores de diferenciação merecem

ser comentados. Por exemplo, há uma presença maior de linhagens ameríndias

no Rio Grande do Sul (16,4%) do que no Rio de Janeiro (8,5%). Isso pode ser

devido ao tipo de colonização ocorrida no estado. Num primeiro momento, houve

um maior contato entre ameríndios e europeus no Sul do país, tendo os escravos

africanos sido introduzidos posteriormente. Isso, provavelmente, levou a um

aumento na freqüência de haplogrupos mitocondriais ameríndios na população

gaúcha, diferente do ocorrido em outras regiões, como o sudeste.

Além de Porto Alegre apresentar essa maior freqüência de haplogrupos

mitocondriais ameríndios, foram encontrados indivíduos que carregavam

linhagens identificadas com os quatro principais haplogrupos fundadores

existentes na América do Sul, A, B, C e D. No Rio de Janeiro, por outro lado, só

foram identificados indivíduos dos haplogrupos A e C. Estes resultados mostram

que embora Porto Alegre possa ser considerado uma cidade fundada nos moldes

de uma colônia de povoamento, ela cresceu demograficamente também através

da absorção de populações gaúchas típicas, oriundas de outras regiões do estado

e que marcadamente teriam trazido a cidade as características de um povo

caracterizado pela mistura de homens europeus com mulheres nativas.

A presença de linhagens européias também é mais freqüente e mais

diversificada em Porto Alegre (5,6%; haplogrupos H, K, T e T2) do que no Rio de

Janeiro (2,5%; haplogrupos H e K). Devido ao fato de termos estudado apenas a

HVS-I não foi possível definir com precisão a presença de H. No entanto, é

provável que sejam realmente pertencentes a este haplogrupo as linhagens

idênticas a seqüência de referencia do HVS-I, encontradas neste estudo, pois tal

haplogrupo é sabidamente o mais freqüente na Europa. A diferença das

distribuições dos haplogrupos europeus nas duas amostras poderia estar

mostrando a importância das mais recentes levas de imigrantes que vieram de

diferentes regiões da Europa para o Rio Grande do Sul, incluindo Porto Alegre.

Em populações brasileiras, identificadas como brancas, Alves-Silva et al

(2000), encontraram para a região Sul, 22% de linhagens mtDNA ameríndias,

12% de linhagens africanas e 66% de linhagens européias, e para a população do

Sudeste, 33% de linhagens ameríndias, 34% de linhagens africanas e 31% de

linhagens européias. Num estudo realizado com populações brancas do Rio

Grande do Sul como um todo, a porcentagem de linhagens européias foi mais

discretas, 48% (Marrero et al, 2005). Porém, o mesmo estudo mostrou que este

número pode chegar a 98% em uma população branca da serrra gaúcha. Por

outro lado, Bortolini et al (1997) estimaram numa amostra de negros de Porto

Alegre, que somente 17% das linhagens eram de origem não-africana. Em um

trabalho em uma população de Ribeirão Preto, onde além da classificação

fenotípica, qualquer indivíduo que reportasse algum tipo de ancestralidade não-

africana foi descartado da amostra, a porcentagem de linhagens não-africanas foi

somente de 5% (Silva-Jr e cols., 1999). Estes dados conjuntamente

mostram que no Brasil, incluindo o Rio Grande do Sul, a proporção de linhagens

mitocondriais de origem africanas em populações negras é marcantemente maior

do que em populações identificadas como brancas.

Marcadores do Cromossomo Y

Os marcadores bialélicos localizados na região não-recombinante do

cromossomo Y discriminam com precisão a origem geográfica dos cromossomos

encontrados em uma determinada população híbrida. Desta forma, não só as

linhagens africanas, mas também as ameríndias, asiáticas e européias são bem

resolvidas com o conjunto de SNPs utilizados neste estudo.

As populações do Rio de Janeiro e Porto Alegre quando comparadas pelo

teste exato de diferenciação populacional apresentaram uma diferença

estatisticamente significante (P<0.001), o que não aconteceu quando as

populações foram comparadas em relação a sua herança matrilineal. No teste de

variação molecular (AMOVA) foi encontrada pouca variabilidade entre os grupos,

sendo que também aqui a maior parte da diversidade é intrapopulacional (F

0.04; P=0.001).

Esta diferença significativa entre as populações deve estar relacionada à

presença de alguns haplogrupos geográfico – específicos presentes em

freqüências relativamente altas na população de Porto Alegre e ausentes na do

Rio de Janeiro. Por exemplo, os haplogrupos ameríndios Q* e Q3* são

encontrados na população de Porto Alegre com freqüências de 3,5% e 1,7%,

respectivamente (Tabela 1 do anexo).

No que se refere aos marcadores de linhagens europeus, como P* e R1*, a

população do Rio de Janeiro apresenta uma maior porcentagem do haplogrupo

R1*(xR1a1) do que a população de Porto Alegre, 22,3% e 14%, respectivamente.

Este haplogrupo é bem distribuído na Europa, sendo encontrado numa freqüência

de 39% na Alemanha (Kayser e cols, 2005). Mas, em contrapartida, em

Camarões o haplogrupo R1* - M173 é encontrado numa freqüência de 40%

(Cruciani et al, 2002) a mais alta para estes haplogrupos em todas as populações

estudadas. Provavelmente exista uma diferença entre os haplogrupos R1*

encontrados na Europa e o encontrado em Camarões, mas até o momento não

há um marcador sensível o suficiente para a identificação dessa variação. Com

base nisso, ainda que, considerando o fato do presente estudo ser em uma

população negra, não temos subsídios teóricos para afirmar que esse

cromossomo R1* encontrado nas populações negras do Rio de Janeiro em alta

freqüência seja de origem africana.

Outro fator de provável diferenciação entre as populações, é a presença do

haplogrupo R1b8 na população do Rio de janeiro (7%) e ausente em Porto

Alegre. Esse haplogrupo é muito freqüente na população ibérica, especialmente

na Espanha (Hurles e cols, 1999; Rosser e cols, 2000). Surpreendentemente, pois

esperava-se que a presença espanhola fosse mais marcante em uma cidade

gaúcha, como Porto Alegre, do que no Rio de Janeiro. Adicionais estudos com a

população identificada como branca de Porto Alegre, já em andamento, poderá

esclarecer melhor detalhes como este.

Ainda considerando os cromossomos europeus, o haplogrupo P*(xR1b8,

xR1) foi encontrado numa freqüência quase quatro vezes maior na população do

Rio Grande do Sul em relação à do Rio de Janeiro. Interessantemente, esta alta

freqüência pode estar revelando o aspecto fundador dos imigrantes açorianos em

Porto Alegre, visto que esse haplogrupo é encontrado em 60% dos cromossomos

Y da Ilha de Açores (Pacheco e cols, 2005; Montiel e cols, 2005).

Outro aspecto a ser considerado, é o de que a diferenciação entre Porto

Alegre e Rio de Janeiro pode ser devido à migração de grupos vindos de

diferentes partes da Europa para o Rio Grande do Sul em épocas mais recentes

(ver comentários em itens anteriores), aumentando a diversidade de linhagens do

Y européias encontradas nesta região, mas não constatadas especificamente

neste estudo por insuficiente precisão dos marcadores utilizados.

No Brasill como um todo, a distribuição do haplogrupo P* em pessoas

classificadas como brancas é de 54%, sendo que região Sul esta freqüência cai

para 42% (Carvalho-Silva e cols, 2001). Recentemente, Marrero et al (2005),

constatou que 95% dos indivíduos classificados como brancos em amostras no

Rio Grande do Sul pertenciam ao haplogrupo P*. Nas populações negras do Rio

de Janeiro e Porto Alegre, as freqüências de P* + seus subtipos R1* e R1b3f

foram, respectivamente, 26,1% e 26,3%. O que mostra que em uma análise mais

geral, a contribuição européia para ambas populações foi muito semelhante, o

que as diferencia é a origem mais específica desses cromossomos europeus.

Foram encontrados haplogrupos típicos do Oriente Médio em freqüências

altas nas duas populações estudadas. O haplogrupo F, foi encontrado numa

freqüência de 10% no Rio de Janeiro e 21% em Porto Alegre. O mais provável é

que estes cromossomos tenham chegado aqui por meio de imigrantes da região

mediterrânea, que historicamente tem mantido contato com as populações do

oriente médio. Além disso, durante sete séculos o sul da Península ibérica foi de

domínio mouro (Bortolini e cols., 2004). A freqüência maior desse haplogrupo em

Porto Alegre pode ser também devido ao fluxo de povos do mediterrâneo

(italianos) para o Sul do Brasil no século XIX. Uma outra possibilidade é que

esses cromossomos tenham vindo para a América por meio de imigrantes

alemães, pois um estudo de 2005 com populações do norte da Europa identificou

uma freqüência de aproximadamente 35% dos haplogrupos da Alemanha como F

(Brion et al, 2005). É bem provável que o haplogrupo F encontrado na Alemanha

seja diferente daquele do Oriente Médio e mediterrâneo. Porém somente a

descoberta de marcadores mais específicos poderiam discriminar melhor estes

cromossomos, de forma que, neste momento fica difícil fazer inferências mais

específicas sobre sua origem em populações brasileiras.

O haplogrupo J, especificamente do Oriente Médio, foi encontrado em

ambas populações, 3% no Rio de Janeiro e 3,5% em Porto Alegre. Como esse

haplogrupo é muito freqüente em judeus, sua presença pode ser justificada pela

chegada ao Brasil de judeus perseguidos durante a II Guerra Mundial. Carvalho e

cols (2000) encontraram uma freqüência desse haplogrupo em torno de 4% em

populações brancas do sul do país.

Foram identificados dois outros haplogrupos não-africanos nas amostras

estudadas além dos já citados anteriormente: K* de origem euro-asiática com

freqüências de 1,4% no Rio de Janeiro e 3,5% em Porto Alegre. A ligação entre

Europa e Ásia tem sido bem documentada com estudos do cromossomo Y

(Bortolini e cols., 2003). Porém aqui, da mesma forma como visto acima, somente

estudos adicionais poderiam desvendar se existem diferenças entre os

cromossomos K europeus daqueles asiáticos. O haplogrupo Y* (apresenta o alelo

ancestral para todo o conjunto de marcadores estudados), por sua vez, é

inespecífico e tem uma distribuição de 3% e 3,5%, no Rio de Janeiro e em Porto

Alegre, respectivamente.

Com relação aos haplogrupos africanos, dentre os homens tipados no Rio

de Janeiro, 56,2% apresentavam ancestralidade paterna africana. Foram

encontrados indivíduos pertencentes a nove haplogrupos distintos (tabela 1 do

anexo). Em Porto Alegre esta porcentagem foi de 37%, distribuídos em seis

haplogrupos.

Quando analisados em conjunto, os dados indicam uma forte diferença

entre as heranças de linhagens maternas e paternas. Enquanto que, em relação

ao marcador matrilineal a população negra do Rio de Janeiro apresentou 89,5%

de linhagens africanas, com os marcadores do cromossomo Y, essa porcentagem

caiu para 56,2%. Na população de Porto Alegre os dados se mostraram tão

divergentes quanto os do Rio de Janeiro, com a herança materna africana em

78% das linhagens e a paterna em 37% das linhagens.

Esses resultados corroboram os dados apresentados por vários autores

(Bortolini e cols., 1999; Alves-Silva e cols., 2000; Carvalho-Silva e cols., 2001;

Salzano e Bortolini, 2002), demonstrando a importância dos cruzamentos

assimétricos na formação da população brasileira. A relação de cruzamentos,

segundo os dados aqui apresentados, parece ser de homens europeus (~26%

dos cromossomos Y na duas populações) com mulheres negras. No entanto,

ainda que haja uma concordância em relação a esses cruzamentos nas duas

regiões, a população de Porto Alegre apresenta uma contribuição materna

ameríndia que ultrapassa 15% dos indivíduos negros estudados, o que indica a

importante contribuição indígena para a formação da população do estado do Rio

Grande do Sul. Essa herança ameríndia é notada também na linhagem paterna,

sendo que esta é a única população negra estudada com indícios de

ancestralidade paterna ameríndia.

A tabela 8 discrimina em maiores detalhes a natureza dos cruzamentos nas

duas amostras estudadas. Neste caso considerou-se somente os indivíduos que

foram concomitantemente estudados para ambos conjuntos de marcadores

(mtDNA e marcadores do Y). Nota-se que ∼50% dos indivíduos nas duas

amostras apresentam linhagens mitocondriais e do cromossomo Y de origem

africana. Valores importantes são também observados quanto ao número de

indivíduos com matrilinhagens africanas e cromossomos Y europeus e/ou

asiáticos ou ameríndios (∼41% e ∼35% para o Rio de Janeiro e Porto Alegre,

respectivamente). Estes resultados conjuntamente mostram que em indivíduos

identificados como negros, cerca da metade deles pode ter genomas

mitocondriais e de Y de origem africana, mas uma boa parcela delas (outros 50%)

apresentam pelo menos um de seus genomas de origem não-africana.

V. REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS

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VI. APÊNDICE

VI.1. Material e Métodos

VI.1.1. Populações de Estudo

As duzentas e setenta e sete amostras foram coletadas junto a voluntários

que buscaram os serviços de análises clínicas oferecidos pela Faculdade de

Farmácia da UFRGS e voluntários doadores de bancos de sangue da cidade do

Rio de Janeiro.

A amostra do estado do Rio Grande do Sul constitui-se de cento e trinta e

três indivíduos classificados como negros residentes em Porto Alegre e região

metropolitana, sendo setenta e seis mulheres e cinqüenta e sete homens. As

amostras foram coletadas sob a supervisão da Profa. Mara Helena Hutz.

A amostra do estado do Rio de Janeiro contitui-se de cento e quarenta e

quatro homens classificados como negro residentes na região metropolitana do

Rio de janeiro, e foi cedida pela Profa. Eliane Bandinelli.

É importante salientar que todos os indivíduos amostrados colaboraram

voluntariamente para este estudo, e depois de serem informados sobre os

objetivos do projeto, assinaram o termo de consentimento. O parecer ético

favorável para a utilização destas amostras em estudos evolutivos foi fornecido

pelo Conselho Nacional de Ética em Pesquisa (CONEP, parecer n° 1333/2002).

VI.1.2. Extração de Dna

A extração de DNA foi realizada a partir de amostras de sangue total

seguindo o protocolo de Lahiri e Nurnberg (1991).

VI.1.3. DNA Mitocondrial

Os primers utilizados para análise do mtDNA são específicos para a

primeira região hipervariável (HVS-I), e as condições de amplificação utilizadas

são as descritas por Bortolini et cols. (1997). A purificação dos produtos da

amplificação para posterior seqüenciamento foi feita com as enzimas

Exonuclease e Fosfastase Alcalina (Marrero, 2005). O seqüenciamento da região

de interesse foi feito através do procedimento padrão recomendado para o uso do

seqüenciador automático ABI310 (Applied Biosystems).

Para evitar artefatos (mutações fantasmas; Bandelt e cols. 2002) que

surgem durante o processo de seqüenciamento, ambas as fitas do DNA foram

seqüenciadas.

VI.1.4. Marcadores do Cromossomo Y

Foram investigados trinta marcadores bialélicos localizados na região não-

recombinante do cromossomo Y. Destes, quatorze estão representados com suas

seqüências e sítios mutados na tabela 1 do apêndice, dentre eles, sete foram

genotipados via PCR – RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) e os

demais por ARMS (Amplification Refractory Mutation System). As condições

específicas de amplificação para cada marcador, bem como as condições das

digestões enzimáticas, quando necessárias, estão nos artigos citados nas

referências da tabela 1.

Os demais marcadores estão representados na tabela 2 do apêndice e foram

genotipados pela técnica de miniseqüenciamento otimizada por Carvalho e Pena,

2005.

As relações evolutivas entre os haplogrupos definidos por esses

marcadores, bem como sua classificação hierárquica para genotipagem estão

representados na figura 1 do apêndice, onde os marcadores utilizados estão

marcados em vermelho.

Tabela 1: Primers utilizados e variação nucleotídica que define o estado alélico ancentral/

derivado.

Primers reversos e

primers específicos para os alelos C e T, T e A, T e C

considerando os locos DYS199, M19 e RPS4Y

711

, respectivamente.

Reação submetida a

PCR touchdown com diminuição de 0,5°C/ciclo.

Loco

Seqüência de Primers

(5’ 3’)

Variação

Nucleotídica

Referência

DYS 199 TAATCAGTCTCCTCCCAGCA

GGTACCAGCTCTTCCTAATTG

GGTACCAGCTCTTCCTAATTA

C/T

Underhill e cols., 1996

DYS287

(YAP)

CAGGGGAAGATAAAGAAATA

ACTGCTAAAGGGGATGGAT

A/G Hammer e Horai, 1995

92R7 GACCCGCTGTAGACCTGACT

GCCTATCTACTTCAGTGATTTCT

C/T Hurles e cols.,1999

M242 AACTCTTGATAAACCGTGCTG

TCCAATCTCAATTCATGCCTC

C/T Bortolini e cols., 2003a

M9 TCAGGACCCTGAAATACAGAACT

TTGAAGCTCGTGAAACAGATTAG

C/G Thomas e cols., 1999

M19

TGAACCTACAAATGTGAAACT

TATTTTTGTGAAGACTGTTGTAT

TATTTTTGTGAAGACTGTTGTAA

T/A

Ruiz-Linares e cols.,1999

RPS4Y

711

CACAAGGGGGAAAAAACAC

GGCAATAAACCTTGGATTTCT

GGCAATAAACCTTGGATTTCC

C/T Bergen e cols., 1999

M173

ATGTTGAACTGAAAGTTGATGCC

TTATCATTTCTGAATATTAACAGAT

CACAA

A/C Montiel e cols., 2005

M17

GTGGTTGCTGGTTGTTACCGG

AGCTGACCACAAACTGATGTAGA

G/ins G Kayser e cols., 2005

SRY

2627

(M167)

TCTGGTTCTGTGTCCTTGGGC

AACCTCTGGAGCGGGACTTTG

C/T Montiel e cols., 2005

12f2

CTGACTGATCAAAATGCTTACAGA

TCTCTTCTAGAATTTCTTCACAGA

ATTG

Del 500 bp Rosser e cols., 2000

M154

ACTTAATTTATAGTTTCAATCCCTC

T/C Underhill et al, 2000

M155 TCTCTAACTTCTGTGAGCCAC G/A Underhill et al, 2000

Tabela 2: Seqüências dos primers para amplificar regiões específicas e flanqueadoras dos SNPs do cromossomo Y utilizados para caracterizar haplogrupos nos protocolos de

miniseqüenciemento Simplex e Multiplex. * utilizados dideoxinucleotídeos marcados fluorescentemente. ª Primers descritos em Underhill et al. 2001

Marcadores do Y Seqüência 5’-3’

Fragme

nto(bp)

Mutação Primer interno 5’-3’ Seqüência Alvo 5’-3’

Primer

(nt)

Multiplex Y D/E a

ddGTP*

Derived Ancestral

Allele (nt) Allele (nt)

PN2

F: GGTAACACCCATAAAGGTTG

R: TTCACTACCAGCCTAAGTAC

247 C/T - CCCTAGGAGGAGAA 15 16 (C) 17 (T)

M174

F: CTCCGTCACAGCAAAAAT

R: AAAAGGAGAAGGACAAGACC

180 T/C - ATGCACCCCTCACTTCTGCACT 22 24 (T) 23 (C)

SY81

F: AGGCACTGGTCAGAATGAAG

R: AATGGAAAATACAGCTCCCC

209 G/A - TTATATTTCATTGTTAACAAAAGTCC 26 29 (A) 27 (G)

M145

F: ACTTGCCTCCACGACTTT

R: CTTTTTGGATCATGGTTCTT

82 G/A TCGTGAAAGTCTGACAA GACACCAGAAAGAAAGGC 35 36 (G) 38 (A)

Multiplex Y D/E b

ddGTP*

M35

F: CATTCATCTTTTTTGTCC

R: TAATCCATGCAGACTTTC

143 G/C - TTTTCCTTTGGGACACTG 18 19 (G) 20 (A)

M33

F: ATACTGGCTTCTGTTCAA

R: CTTACAATGGGAGTCACT

165 A/C GCCACGTCGTGAAAGTCTGACAA GTATAATATGTCTGAGAT 41 49 (A) 42 (C)

M75

F: AAAGTCACATTCCACACA

R: GCATTTGTGAATTTTTAT

224 G/A AGGTGCCACGTCGTGAAAGTCTGACAA AATTATCAAACCACATCC 45 46 (G) 58 (A)

Multiplex Y E3a

ddATP*

M58

F: CCTCTTAACTTGTAGAAACA

R: AAAAACTAAACTCTAAATCTCT

202 G/A - TTG TCTTCTGCAGAATTGGC 20 22 (G) 21 (A)

M191

F: ACAGCGAGCAGTAAGTAAAAC

R: TACCCAGACACACCAAAATAT

152 T/G AGTCTGACAA AAAATATCTCATATTTTCAT 30 31 (T) 33 (G)

M116.2

F: AAAAACTGCAAGTAGATGAAAA

R: AAATAACTCACCAAAGGAAATG

218 A/C GAAAGTCTGACAA AAAAAATAATTTCAAACTGATA 35 36 (A) 42 (C)

M10

F: AAGACAATGAAGGGAGAGACT

R: TTTCTGTTTCTTTCACTTCAA

170 T/C TGCCACGTCGTGAAAGTCTGACAA GTAAAAACTTTACAAGTGCT 44 45 (T) 47 (C)

Simplex Y E3a

ddATP*

M149

F: TGCCTAACAAAACTACACT

R: TTTTACTTGTTCGTGTACTTTCAA

134 G/A - TAATAGAACACAAGC 15 19 (G) 16 (A)

Multiplex Y E3b

ddGTP*

F: ACAGCCGCCCTATAGAGT

R: GGTTCTTTGGAGGATTTTG

190 G/C - TTGCTGTGATTCCTGATGTG 20 21 (G) 23 (C)

M78

F: TGAACACAAATTGATACACT

R: TGAAAAGCAAGTACTATGAC

88 C/T TGACAA TTGAAATATTTGGAAGGGC 25 26 (C) 27 (T)

M281

F: CTAGAAATGCAAATTCCT

R: GGTTGCACAAACTCAGTA

99 G/A GTCTGACAA ATGGGGGGAACAGGGAAGTC 29 30 (G) 31 (A)

M123

F: ATGCTCTCAGGGGAAAAT

R: TGTTCCCCCCATAGTTTT

167 G/A GTGAAAGTCTGACAA ATCTGAACTAGCATATCA 33 34 (G) 39 (A)

M81

F: CTCAGCTACACATCTCTTAACA

R: GGAGCAATACTGTACTTTCACT

248 C/T CACGTCGTGAAAGTCTGACAA GTGTGAGTATACTCTATGAC 41 42 (C) 52 (T)

Simplex Y B

ddATP*

M60

F: GCACTGGCGTTCATCATCT

R: ATGTTCATTATGGTTCAGGAGG

388 -/T - TAACCACTGTGTGCCTGAT 19 24 (-) 20 (T)

Simplex F ddGTP*

M213

F: TATAATCAAGTTACCAATTACTGGC

R: TTTTGTAACATTGAATGGCAAA

409 T/C AAGTCTGACAA TCAGAACTTAAAACATCTCGTTAC 35 38 (T) 36 (C)

Figura 1: Relações evolutivas entre os marcadores do cromossomo Y. Jobbling e Tyler-Smith, 2003.

VI.1.5. Análise dos dados:

A genotipagem dos marcadores do cromossomo Y e a classificação dos

haplogrupos foi realizada de forma hierárquica seguindo recomendação do

Consórcio do cromossomo Y.

Os cromatogramas resultantes do seqüenciamento do mtDNA foram

analisados no programa Chromas Pro. As seqüências foram editadas com os

programas BIOEDIT e MEGA 3.

Foi utilizada a metodologia descrita em Bandelt e cols. (2002) e Yao e cols.

(2004) para verificar a existência de mutações fantasma nas seqüências do

mtDNA. Os programas NETMAT e NETWORK foram utilizados para avaliar a

qualidade das seqüências das amostras aqui estudadas, depois das mesmas

terem sido validadas.

VII. ANEXO

VII.1. Resultados Adicionais

Tabela 1: Freqüências dos haplogrupos do cromossomo Y encontradas nas

populações de Porto Alegre e Rio de Janeiro.

Y Haplogrupo RJ POA

E3a* 0,33 (43) 0,158 (09)

E3a7 0,12 (15) 0,09 (05)

E3a1 0,007 (01) 0

E3b* 0,038 (05) 0,035 (02)

E3b1 0 0,035 (02)

E3b2 0,007 (01) 0,017 (01)

E* 0,031 (04) 0

E1 0,007 (01) 0

E2 0,007 (01) 0

B* 0,015 (02) 0,035 (02)

F* 0,1 (13) 0,21 (12)

J* 0,031 (04) 0,035 (02)

K* 0,015 (02) 0,035 (02)

Q* 0,007 (01) 0,035 (02)

Q3* 0 0,017 (01)

P* 0,023 (03) 0,123 (07)

R1* 0,231 (30) 0,140 (08)

R1b3f 0,007 (01) 0

0,031 (04)

0,035 (02)

Total 1 (130) 1 (57)

Tabela 2: Freqüências dos haplogrupos do mtDNA encontradas em Porto Alegre.

mtDNA – Porto Alegre (n=109)

Ameríndio Africano Europeu

0,018

0,028

0,100

0,018

0,045

0,174

0,212

0,349

0,018

0,01

0,164 0,780 0,056

Tabela 3: Freqüências dos haplogrupos do mtDNA encontradas no Rio de janeiro.

mtDNA – Rio de Janeiro (n=94)

Ameríndio Africano Europeu

A C L0 L1 L2 L3 H K

0,021 0,064 0,117 0,234 0,277 0,267 0,01 0,01

0,085 0,895 0,02

Tabela 4: Linhagens do mtDNA e do Cromossomo Y encontradas na população

do Rio de Janeiro, por indivíduo amostrado.

HAPLOGRUPOS Indivíduo

mtDNA Y Cromossomo

RJ 42 H, HV, U, R E3a*

RJ 12 K R1*

RJ 84 A2 E3b2

RJ 67 A2 E3a*

RJ 38 C1 E3a*

RJ 05 C1 E3a*

RJ 01 C1

RJ 109 C1

RJ 48 C1 E3a*

RJ 40 C1 R1*

RJ 53 L0a1 E3a*

RJ 14 L0a1 R1*

RJ 44 L0a1 E3a*

RJ 4961 L0a1 P*

RJ 4039 L0a1

RJ 4827 L0a1 P*

RJ 113 L0a2 R1*

RJ 51 L0a2 F*

RJ 4916 L0a2 R1*

RJ 41 L0a2 F*

RJ 29 L0d1 J*

RJ 89 L1b E3a*

RJ 4784 L1b E3a*

RJ 86 L1b E*(E3a)

RJ 4669 L1b

RJ 66 L1b R1*

RJ 35 L1b F*

RJ 117 L1b E3a7

RJ 95 L1b E3a*

RJ 5261 L1c

RJ 119 L1c

RJ 34 L1c E*(E3a)

RJ 97 L1c K*

RJ 47 L1c1 F*

RJ 90 L1c1 E3a7

RJ 08 L1c1 E3a*

RJ 4754 L1c1 E3a*

RJ 190 L1c2 E3a1

RJ 5078 L1c2 E3a7

RJ 4767 L1c2

RJ 04 L1c2 E3a*

RJ 83 L1c2 E3a*

RJ 03 L1c2 F*

RJ 11 L2a1a E1*

RJ 4766 L2a1a F*

RJ 4781 L2a1a E3a7

RJ 4734 L2a1a J*

RJ 13 L2a1a F*

RJ 4667

L2aα1

RJ 32

L2aα1

R1*

RJ 4948

L2aβ1

E3b*

HAPLOGRUPOS Indivíduo

mtDNA Y Cromossomo

RJ 73

L2aβ1

R1*

RJ 4915

L2aβ1

RJ 39

L2aβ1

E3a7

RJ 24

L2aβ1

R1*

RJ 58

L2aβ1

RJ 114

L2aβ1

RJ 55

L2aβ1

R1*

RJ 82

L2aβ1

R1*

RJ 4671

L2aβ1

R1*

RJ 15

L2aβ2

R1*

RJ 26 L2b E3a*

RJ 78 L2b E3b*

RJ 06 L2b1 E3a*

RJ 76 L2b1 E3a*

RJ 02 L2b1 R1*

RJ 4848 L2b1 R1*

RJ 18 L2c E3b*

RJ 118 L2c E3a*

RJ 37 L3 R1b3f

RJ 36 L3b E3a*

RJ 19 L3b

RJ 20 L3b

RJ 4857 L3d R1*

RJ 4900 L3d J*

RJ 64 L3d E3a7

RJ 5246 L3d2 F*

RJ 111 L3d2 E3a7

RJ 4828 L3d2 E3a*

RJ 5159 L3d2 E3a7

RJ 07 L3e1 E3a*

RJ 62 L3e1 E3a*

RJ 43 L3e1a R1*

RJ 50 L3e1b R1*

RJ 4804 L3e3

RJ 94 L3e3 E3a*

RJ 45 L3e3

RJ 4718 L3e3 R1*

RJ 102 L3e3 E3a7

RJ 46 L3e3 R1*

RJ 69 L3f E3a*

RJ 57 L3f E3b*

RJ 61 L3f1 E3a7

RJ 70 L3f1 F*

RJ 09 F*

RJ 10 E3a*

RJ 16 E2*

RJ 17 R1*

RJ 21 R1*

RJ 22 E3b*

RJ 23 E3a*

RJ 25 E3a*

RJ 28 E3a*

RJ 30 E3a*

RJ 31 E3a7

RJ 33 E3a*

HAPLOGRUPOS Indivíduo

mtDNA Y Cromossomo

RJ 49 E*(xE3a)

RJ 52 E3a*

RJ 54 E3a*

RJ 59 E3a*

RJ 60 K*

RJ 63 E3a*

RJ 65 E3a7

RJ 68 E3a*

RJ 71 R1*

RJ 74 R1*

RJ 75 E3a*

RJ 77 Y*

RJ 79 R1*

RJ 80 R1*

RJ 85 E3a7

RJ 88 E3a*

RJ 91 Y*

RJ 92 P*

RJ 96 E3a*

RJ 98 F*

RJ 99 F*

RJ 100 E*(xE3a)

RJ 101 F*

RJ 103 E3a*

RJ 104 E3a*

RJ 106 Y*

RJ 107 R1*

RJ 108 E3a*

RJ 120 B*

RJ 4639 R1*

RJ 4674 E3a*

RJ 4720 R1*

RJ 4747 Y*

RJ 4807 J*

RJ 4812 E3a*

RJ 4899 E3a7

RJ 4917 E3a7

RJ 5028 R1*

N total 94 130

Tabela 5: Linhagens do mtDNA e do Cromossomo Y encontradas na população

de Porto Alegre, por indivíduo amostrado.

HAPLOGRUPO INDIVÍDUO

mtDNA Cromossomo Y

POA 154 A

POA 472 A

POA 537 C1

POA B46 C1 B*

POA 132 C1 P*

POA 356 C1

POA 541 C1

POA 040 C1

POA 610 C1 E3a*

POA 466 C1

POA B08 C1

POA 474 C1

POA B24 C1 E3b*

POA 260 D1

POA 408 D1

POA 126 B4

POA B41 B4

POA 319 B4

POA 452 H, HV, U, R F*

POA 539 H, HV, U, R

POA 017 K

POA 288 K

POA 007 T2

POA 325 T F*

POA 491 L0a1a

POA 456 L0a1a

POA 598 L0a1a E3a*

POA 763 L0a1a

POA B48 L0a1a Y*

POA 634 L1b

POA 367 L1b E3a*

POA 425 L1b F*

POA 221 L1b

POA 432 L1c1 J*

POA 542 L1c1

POA 480 L1c1

POA 446 L1c1

POA 448 L1c1

POA478 L1c1 R1*

POA 461 L1c2

POA 321 L1c2

POA 415 L1c2 E3a*

POA 207 L1c2

POA B39 L1c2 R1*

POA 457 L1c3

POA 458 L1c3

POA 158 L1c3

POA 517 L1c3

POA B51 L2a1a E3a7

POA 463 L2a1a

POA 455 L2a1a

HAPLOGRUPOS Indivíduo

mtDNA Y Cromossomo

POA 540 L2a1a J*

POA 451

L2a1β1

POA B42

L2a1β1

POA B37

L2a1β1

E3a7

POA 889

L2a1β1

POA 725

L2a1β1

POA B47

L2a1β1

POA 732

L2a1β1

POA B30

L2a1β1

POA 241

L2a1β1

POA 680

L2a1β1

POA 479

L2a1β2

POA B40

L2a1β3

E3b1

POA 018

L2a1β3

POA 596 L2b

POA 476 L2b

POA 453 L2b

POA 484 L2b

POA B52 L2b E3a*

POA 407 L2b E3a7

POA 269 L3

POA 731 L3b F*

POA 605 L3b

POA164 L3b

POA493 L3b

POA 487 L3b2

POA 558 L3b2 E3a7

POA 554 L3d

POA 154 L3d1

POA 472 L3d1

POA 449 L3e1

POA B36 L3e1 E3a7

POA 376 L3e1 R1*

POA 494 L3e1

POA 713 L3e1

POA 310 L3e1a

POA 482 L3e1a

POA 730 L3e1a

POA 465 L3e1a

POA 477 L3e1a E3a*

POA 008 L3e2

POA 543 L3e2 P*

POA 084 L3e2b

POA 681 L3e2b

POA 335 L3e3

POA 611 L3e3 E3b2

POA 459 L3e3

POA 010 L3e3

POA 464 L3f

POA 111 L3f

POA 492 L3f

POA 585 L3f1

POA 534 L3f1

POA 277 L3f1 F*

POA B35 L3f1 R1*

HAPLOGRUPOS Indivíduo

mtDNA Y Cromossomo

POA 460 L3g

POA 092 L3g

POA 486 L3g

POA B04 E3a*

POA B19 P*

POA B20 E3a*

POA B38 Y*

POA B41 F*

POA B43 R1*

POA B50 R1*

POA 034 E3a*

POA 037 F*

POA 063 F*

POA 077 Q3*

POA 122 F*

POA 217 E3b*

POA 236 P*

POA 245 R1*

POA 283 P*

POA 489 E3b1

POA 352 P*

POA 395 F*

POA 469 K*

POA 612 R1*

POA 635 F*

POA 807 F*

N total 109 57

Tabela 6: Seqüências do mtDNA encontradas na amostra do Rio de Janeiro e

seus respectivos haplogrupos

Amostra Posição do Sítio Variável Haplogrupo

RJ42 rCRS H, HV, U, ou R*

RJ12 093 224 311 K

RJ84 111 223 266 290 319 362 A2

RJ67 111 172 223 290 319 362 A2

RJ40 223 260 298 325 327 C1

RJ48 223 260 298 325 327 C1

RJ109 223 298 325 327 C1

RJ01 189 223 298 325 327 C1

RJ05 051 93 223 298 325 327 C1

RJ38 051 223 287 298 311 325 327 C1

RJ53 129 148 168 172 187 188G 189 223 230 278 311 320 L0a1

RJ14 129 148 168 172 187 188G 189 223 230 278 293 311 320 L0a1

RJ4039 129 148 168 172 187 188G 189 223 230 278 293 311 320 L0a1

RJ4827 129 148 168 172 187 188G 189 223 230 278 293 311 320 L0a1

RJ44 093 129 148 168 172 187 188G 189 223 230 278 293 311 320 L0a1

RJ4961 093 129 148 168 172 187 188G 189 223 230 278 293 311 320 L0a1

RJ113 148 172 187 188A 189 223 230 311 320 L0a2

RJ51 148 172 187 188G 189 223 230 311 320 L0a2

RJ4916 148 172 187 188G 189 223 230 311 320 L0a2

RJ41 148 172 187 188G 189 223 230 311 320 L0a2

RJ29 129 187 189 223 230 239 243 294 311 L0d1

RJ86 111 126 187 189 223 264 270 278 293 311 L1b

RJ89 126 187 189 223 264 270 278 293 311 L1b

RJ4784 126 187 189 223 264 270 278 293 311 L1b

RJ35 126 148 187 189 223 264 270 278 311 L1b

RJ4669 126 187 189 223 264 270 278 311 L1b

RJ66 126 187 189 223 264 270 278 311 L1b

RJ117 126 187 189 223 264 270 278 311 L1b

RJ95 126 187 189 223 264 270 278 311 L1b

RJ34 129 187 189 223 278 294 311 360 L1c

RJ5261 129 187 189 223 261 278 311 360 L1c

RJ97 129 187 189 223 274 278 287 294 311 320 360 L1c

RJ119 129 187 189 223 278 294 311 355 360 362 L1c

RJ47 129 187 189 223 278 293 294 311 360 L1c1

RJ4754 129 187 189 223 278 293 294 311 360 L1c1

RJ90 129 187 189 223 274 278 293 294 311 360 L1c1

Amostra Posição do Sítio Variável Haplogrupo

RJ08 093 129 187 189 223 263 278 293 294 311 360 L1c1

RJ190 129 187 189 223 265C 278 286G 294 311 320 360 L1c2

RJ5078 129 187 189 223 265C 278 286G 294 311 320 360 L1c2

RJ4767 129 187 189 223 265C 278 286G 294 311 320 360 L1c2

RJ03 129 187 189 223 265C 278 286G 294 311 355 360 L1c2

RJ04 129 187 189 223 265C 278 286G 294 311 360 L1c2

RJ83 129 145 187 189 223 234 265C 278 286G 294 311 360 L1c2

RJ4667 223 234 249 278 294

L2a α1

RJ32 223 234 249 278 294

L2a α1

RJ4948 223 278 294 309

L2a β1

RJ73 193 213 223 239 278 294 309

L2a β1

RJ4915 093 223 256 278 292 294 309

L2a β1

RJ39 223 278 294 309

L2a β1

RJ24 223 256 278 294 309

L2a β1

RJ58 223 256 278 294 309

L2a β1

RJ114 093 223 256 278 294 309

L2a β1

RJ55 093 223 256 278 294 309

L2a β1

RJ82 093 223 256 278 294 309

L2a β1

RJ4671 093 223 256 278 294 309

L2a β1

RJ15 189 193 223 245 278 294 309 L2a β2

RJ11 092 223 278 286 294 309 L2a1a

RJ4766 092 223 278 286 294 309 L2a1a

RJ4781 223 278 286 294 309 L2a1a

RJ4734 223 278 286 294 309 L2a1a

RJ13 223 278 286 294 309 L2a1a

RJ26 114A 129 213 223 278 354 L2b

RJ78 114A 129 213 223 278 354 L2b

RJ06 114A 129 213 223 278 355 362 L2b1

RJ76 114A 129 213 223 278 355 362 L2b1

RJ02 114A 129 213 223 278 355 362 L2b1

RJ4848 114A 129 213 223 278 311 362 L2b1

RJ18 223 264 278 L2c

RJ118 223 264 278 L2c

RJ37 124 223 L3

RJ36 124 223 278 362 L3b

RJ19 124 145 223 278 362 L3b

RJ20 124 145 223 278 362 L3b

RJ64 124 223 319 L3d

RJ4900 124 223 319 L3d

Amostra Posição do Sítio Variável Haplogrupo

RJ4857 124 223 L3d

RJ5159 124 223 256 L3d2

RJ4828 124 223 256 L3d2

RJ111 124 223 256 L3d2

RJ5246 124 223 256 L3d2

RJ62 223 327 L3e1

RJ07 176 223 327 L3e1

RJ43 185 223 327 L3e1a

RJ50 223 325D 327 L3e1b

RJ46 223 265T L3e3

RJ102 223 265T L3e3

RJ4718 223 265T L3e3

RJ45 223 265T 355 L3e3

RJ94 223 265T 316 L3e3

RJ4804 223 265T 288 L3e3

RJ69 209 223 311 L3f

RJ57 209 223 311 L3f

RJ61 129 209 223 292 295 311 L3f1

RJ70 093 129 209 223 292 295 311 L3f1

Nota: Os números representam a posição dos sítios variáveis relativo à seqüência

de referência (rCRS: Revised Cambridge Reference Sequence; Andrews e cols.,

1999), menos 16000 pares de bases.

* Somente a seqüência da HVS-I não permite discriminar com precisão entre

estes haplogrupos europeus.

Tabela 7: Seqüências do mtDNA encontradas na amostra de Porto Alegre e seus

respectivos haplogrupos

Amostra Posição do Sítio Variável Haplogrupo

POA452 rCRS H, HV, U, R*

POA539 rCRS H, HV, U, R*

POA017 224 311 K

POA288 093 224 311 K

POA325 126 294 296 311 T

POA007 126 193 295 297 304 T2

POA154 126 145 223 278 290 319 362 A

POA472 126 223 279 291 319 362 A

POA126 189 217 B4

POA319 189 217 311 319 B4

POAB41 189 217 311 B4

POA537 223 298 325 327 C1

POA356 223 298 325 327 C1

POA132 223 298 325 327 C1

POAB46 223 298 325 327 C1

POA541 223 298 325 327 356 C1

POA040 223 298 325 327 C1

POA610 051 223 287 298 311 325 327 C1

POA466 051 223 298 325 327 C1

POAB08 051 223 298 325 327 C1

POA474 223 298 325 327 362 C1

POAB24 223 325 327 C1

POA260 189 223 325 362 D1

POA408 223 325 362 D1

POAB48 129 148 168 172 187 188G 189 223 230 278 293 311 320 L1ala

POA763 129 148 168 172 187 188G 189 223 230 278 311 320 L1ala

POA456 129 148 168 172 187 188G 189 223 230 278 293 311 320 L1ala

POA491 129 148 168 172 187 188G 189 223 230 278 293 311 320 L1ala

POA598 093 129 148 168 172 187 188A 189 223 230 278 293 311 320 L1ala

POA634 126 187 189 223 264 270 278 311 L1b

POA221 126 187 189 223 264 270 278 293 311 L1b

POA425 126 187 189 223 264 270 278 293 311 L1b

POA367 126 187 189 223 264 270 278 311 L1b

POA448 129 187 189 223 278 293 294 311 360 L1c1

POA478 129 187 189 223 278 293 294 311 360 L1c1

POA446 129 163 187 189 209 223 278 293 294 311 360 L1c1

Amostra Posição do Sítio Variável Haplogrupo

POA480 129 163 187 189 209 223 278 293 294 311 360 L1c1

POA542 093 129 187 189 223 263 278 293 294 311 360 L1c1

POA432 093 129 187 189 223 263 278 293 294 311 360 L1c1

POAB39 129 187 189 223 265C 278 286G 294 311 360 L1c2

POA207 129 187 189 223 265C 278 286G 294 311 360 L1c2

POA461 129 187 189 223 265C 278 286G 294 311 360 L1c2

POA415 129 187 189 223 265C 278 286G 294 311 320 360 L1c2

POA321 129 187 189 213 223 234 265C 278 286G 294 311 360 L1c2

POA457 129 189 215 223 278 294 311 360 L1c3

POA458 129 189 215 223 278 294 311 355 360 L1c3

POA158 129 189 215 223 278 294 311 360 L1c3

POA517 129 189 215 223 278 294 311 360 L1c3

POA680 223 278 291 294 309

L2a1 β1

POA241 129 223 278 294 309

L2a1 β1

POAB30 129 223 278 294 309

L2a1 β1

POA732 093 223 256 278 294 309

L2a1 β1

POAB47 093 223 256 278 294 309

L2a1 β1

POA725 223 256 278 294 309

L2a1 β1

POA889 092 223 278 294 309

L2a1 β1

POAB37 092 223 278 294 309

L2a1 β1

POAB42 223 278 294 309

L2a1 β1

POA451 223 278 294 309

L2a1 β1

POA479 189 223 278 294 309

L2a1 β2

POA018 189 192 223 278 294 309

L2a1 β3

POAB40 189 192 223 278 294 309

L2a1 β3

POA540 223 278 286 294 309 L2a1a

POA455 223 278 286 294 309 L2a1a

POA463 223 278 286 294 309 L2a1a

POAB51 223 278 286 294 309 L2a1a

POA407 114A 129 213 223 274 278 L2b

POAB52 114A 129 213 223 274 278 L2b

POA484 114A 129 213 223 274 278 L2b

POA453 114A 129 213 223 278 354 L2b

POA596 114A 223 264 274 278 L2b

POA476 223 264 274 278 L2b

POA269 223 L3

POA605 124 223 278 362 L3b

POA731 124 223 278 362 L3b

POA164 223 278 294 362 L3b

100

Amostra Posição do Sítio Variável Haplogrupo

POA493 223 278 294 362 L3b

POA558 124 223 278 311 362 L3b2

POA487 124 223 278 311 362 L3b2

POA554 124 223 278 290 292 312 362 L3d

POA154 124 145 223 278 290 319 362 L3d1

POA472 124 223 278 290 319 362 L3d1

POA449 176 223 327 L3e1

POAB36 223 327 L3e1

POA376 223 327 L3e1

POA713 223 327 L3e1

POA494 223 327 L3e1

POA310 185 223 311 327 L3e1a

POA482 185 223 311 327 L3e1a

POA730 185 223 327 L3e1a

POA465 185 209 223 327 L3e1a

POA477 185 209 223 327 L3e1a

POA008 093 192 223 320 L3e2

POA543 192 223 320 L3e2

POA084 172 189 223 320 L3e2b

POA681 172 189 223 320 L3e2b

POA611 189 223 265T L3e3

POA335 189 223 265T L3e3

POA459 223 265T L3e3

POA010 223 265T L3e3

POA492 192 209 223 311 L3f

POA464 209 223 311 L3f

POA111 209 223 311 L3f

POA534 129 209 223 292 295 311 L3f1

POA585 129 209 223 292 295 311 L3f1

POA277 209 223 292 311 L3f1

POAB35 209 223 292 311 L3f1

POA460 093 223 287 293T 301 311 355 362 L3g

POA486 093 223 287 293T 301 311 355 362 L3g

POA092 093 223 293T 301 311 355 362 L3g

101

Nota: Os números representam a posição dos sítios variáveis relativo à seqüência

de referência (rCRS: Revised Cambridge Reference Sequence; Andrews e cols.,

1999), menos 16000 pares de bases.

* Somente a seqüência da HVS-I não permite discriminar com precisão entre

estes haplogrupos europeus.

102

Tabela 8: Origem das linhagens mitocondriais e do cromossomo Y por individuo

amostrado tipado concomitantemente para ambos os sistemas genéticos.

Rio de Janeiro

mtDNA Y-Cromossomo Número (%)

Africano Africano 37 (48,7)

Africano Europeu/Euro-asiático 31 (40,8)

Africano Ameríndio 0

Ameríndio Africano 5 (6,6)

Ameríndio Europeu 1 (1,3)

Europeu Africano 1 (1,3)

Europeu Europeu 1 (1,3)

Porto Alegre

mtDNA Y-Cromossomo Número (%)

Africano Africano 19 (51,4)

Africano Europeu/Euro-asiático 11 (29,7)

Africano Ameríndio 2 (5,4)

Ameríndio Africano 2 (5,4)

Ameríndio Europeu 1 (2,7)

Europeu Africano 0

Europeu Europeu 2 (5,4)

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